實驗室高低溫一體機壓縮機的作用非常重要，這是無可厚非的。一旦壓縮機發生故障的話，就需要及時更換壓縮機，但是壓縮機的更換并不是想象的那么簡單的。
在實驗室高低溫一體機壓縮機換裝之前檢查造成原壓縮機損壞的原因，對不良部件進行更換，因為實驗室高低溫一體機其它部件的損壞也會直接導致壓縮機損壞。將實驗室高低溫一體機原來損壞壓縮機拆除后，對系統進行氮氣吹污處理，方可連接新的壓縮機系統。
實驗室高低溫一體機在焊接作業時，為了不使銅管內壁生成氧化膜，建議通入氮氣，氮氣通往的時間要足夠。禁止在更換實驗室高低溫一體機壓縮機或其他零件時，將壓縮機作為真空泵來排空外機管路中的空氣，否則將燒毀壓縮機，使用真空泵來抽真空。更換實驗室高低溫一體機壓縮機時加入符合壓縮機性質的冷凍油，且冷凍油要適量，一般來說新的原裝壓縮機有冷凍油。
實驗室高低溫一體機更換壓縮機時要注意防止系統中冷凍油過量，否則會導致系統的換熱效果降低，從而使系統壓力偏高，損壞系統和壓縮機。實驗室高低溫一體機加注制冷劑時不要太快，否則會產生液擊，致使閥片斷裂，造成壓縮機內響失壓。
在更換實驗室高低溫一體機壓縮機時，及時更換干燥過濾器。因為干燥過濾器中的干燥劑已經飽和，失去了濾水功能，把原系統中的冷凍油清洗干凈，因為新泵中已注入足量產冷凍滑油，不同牌號的冷凍油不能混用，否則會變質造成潤滑不良，導致壓縮機拉缸，變黃，燒焦。
實驗室高低溫一體機中壓縮機只有一種正確的接線方式，其他都是錯誤的。由于誤接線，熱保護器可能喪失保護功能，而導致壓縮機燒毀，一般會造成副線圈燒毀，對三相壓縮機，要有相序保護裝置。
實驗室高低溫一體機壓縮機安裝完畢后，要檢查壓縮機工作正常，如：吸氣壓力/溫度，排氣壓力/溫度，油壓差壓力等系統參數。如果參數超出正常值，弄清楚系統參數異常的原因。
