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1.2.1 將儀器置于平穩的操作臺面，其工作環境應避免震動和化學物質的侵蝕。
1.2.2 將懸桿、排液槽安裝在指D的部位。
1.2.3 插上電源，打開儀器電源開關，操作面板顯示設定的轉速旋轉ADJ調整旋鈕到預定的轉速（一般為60~120轉/分）
1.2.1 啟動機器按START/STOP 按下時泵開始工作，機器上放的紅色指示燈亮，再按抬起時泵停止工作。 1.3 智能集菌儀無菌檢測操作過程
1.3.1 取出一次性培養器先檢查包裝是否無損，在無菌室內打開無菌包裝。
1.3.2 將一次性培養器逐個插放在不銹鋼排液槽上。
1.3.3 將一次性培養器的彈性軟管裝入集菌儀的蠕動泵頭，要求定位準確，軟管走勢順暢。
1.3.1 用中間的針孔插到樣品瓶里，然后用尾端針孔插到稀釋液里，開機，將稀釋液倒置，把液體打入樣品瓶中，樣品瓶中液體加滿后，放下稀釋液，再倒置樣品瓶，使樣品通過培養器進行集菌。
1.3.5 完成集菌后，開啟已滅菌好的培養基瓶，將前端針頭插入培養基中，稀釋液瓶中針孔不要拔出。 1.3.6 摘下一次性培養器頂部空氣濾器開口的膠塞，套在一次性培養器的底口上，用軟管夾子依次開閉軟管，開啟集菌儀，將培養基泵入指D的培養器內。（先取兩個夾子夾住彈性軟管定位處的兩根管制，先加入改良馬丁培養基；再取另外一個夾子夾住另外一根管子，并拔去先前的兩個夾子，加入硫乙醇酸鹽流體培養基）。
1.3.7 用夾子夾閉與一次性培養器連接部的軟管，留出5-6cm軟管，剪除其余部分，并將開口端插在空氣濾器的開口上。
1.3.8 分別按照規定時間培養。
1.3.9 觀察培養情況，若需取樣分離培養，可將軟管消毒，用無菌注射器插入軟管抽取所需；量做進一步檢查 。