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利用超聲波DNA打斷儀進(jìn)行NGS建庫(kù)有哪些優(yōu)勢(shì)?

閱讀:1695      發(fā)布時(shí)間:2023-6-5
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超聲波DNA打斷儀,用于把DNA片段切斷建庫(kù)。建庫(kù),即文庫(kù)制備,是指將樣本處理成可被測(cè)序儀讀取的DNA片段,該片段需滿足一定的長(zhǎng)度,且在兩端都連接了指定的序列(錨定序列、測(cè)序引物序列、標(biāo)簽序列等)。

超聲波DNA打斷儀通過(guò)壓電轉(zhuǎn)換器,將電信號(hào)轉(zhuǎn)變?yōu)楦哳l聲波信號(hào),產(chǎn)生數(shù)百萬(wàn)的水分子”空穴”,利用“空穴” 在幾微秒內(nèi)變大、破裂產(chǎn)生的瞬時(shí)流體剪切力,通過(guò)等溫、非接觸的方式對(duì)樣品進(jìn)行打斷、勻漿和混合。


超聲法優(yōu)勢(shì)在于打斷的DNA片段更為集中且無(wú)偏好性,是目前NGS建庫(kù)中片段化的金標(biāo)準(zhǔn)。可在密閉容器、無(wú)菌、可超微量條件下進(jìn)行破碎。相比傳統(tǒng)的探頭超聲波細(xì)胞粉碎機(jī),該儀器具有一次可同時(shí)檢測(cè)多個(gè)樣品、實(shí)驗(yàn)效率高、無(wú)需頻繁操作探頭、避免樣本交叉污染等優(yōu)勢(shì)。儀器標(biāo)配低溫恒溫裝置(雙循環(huán)恒溫裝置),便于樣品在4-10℃環(huán)境內(nèi)工 作,使能量分布均勻,超聲作用。逐漸成為ChIP(染色質(zhì)免疫共沉淀)和DNA剪切研究平臺(tái)必要的標(biāo)準(zhǔn)化工具。

 

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