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超聲波細胞粉碎儀的原理并并不是太神密、太繁雜。簡易說就是說將電磁能根據超聲波換能器變換為聲音，這類動能根據液體介質而變為一個個聚集的氣泡，這種氣泡快速爆裂，造成的強大的動能，進而具有粉碎體細胞等化學物質的功效。

    超聲波裂解是化學物質介質中的一種延展性機械波，它是一種起伏方式，因而它能夠用以檢測身體的生理學及病理學信息內容，既確診超聲。另外，它也是一種動能方式，當做到一定使用量的超聲在植物體內散播時，根據他們中間的相互作用力,能造成植物體的作用和構造產生變化，即超聲微生物效應。超聲對細胞的作用關鍵有熱效應，空化效應和機械設備效應。熱效應是當超聲在介質中散播時，滑動摩擦力阻攔了由超聲造成的分子結構振動，使一部分能量轉化為部分高燒（42-43℃），由于一切正常機構的臨界值致死溫度為45.7℃，而惡性腫瘤機構比一切正常機構敏感度高，故在這里溫度下腫瘤干細胞的新陳代謝出現阻礙，DNA、RNA、蛋白質合成遭受危害，進而破壞力腫瘤細胞而一切正常機構不受影響。空化效應是指在直接超聲作用下，植物產生空化現象，由于機械設備切割壓力和湍流引起空泡振動及其強烈爆炸，造成惡性腫瘤出血、機制分裂和萎縮。除此之外，瞬間溫度（約5000）和髙壓（約500104Pa）在空蝕泡裂開時候造成水蒸氣的催化裂解。OH氧自由基和H原子的空氣氧化是由原子和.H原子造成的。H原子的氧化還原反應體現了多元化化學物質的增溶、溶解、脂類空氣氧化和體細胞毀壞。機械設備效應是超音波散播的關鍵影響因素，在超音波散播的全部全過程中，物質顆粒物的復原和拓展*壓力的轉變，對植物細胞導致損害。破壞力功效的高低與超聲的頻率和抗壓強度息息相關。