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1. 集菌儀的使用準備工作
   1.1打開電源。
   1.2檢查儀器運行是否正常，是否有異常噪聲和振動。
   1.3加、減速是否平滑有效。
   1.4顯示屏是否顯示正常。
2.集菌儀的操作方法
   2.1取出集菌培養器先檢查包裝是否完好無損，在無菌室打開無菌包裝袋。
   2.2將集菌培養器逐個放在不銹鋼座上。
   2.3將集菌培養器的導管裝入智能集菌儀泵頭，要求定位，導管勢順暢。
   2.4打開帶檢樣品，插入針孔并，然后將樣品瓶定位。
   2.5拔去進樣雙芯針管的護套，插入樣品中，按“Run”鍵，開啟集菌儀，再按“30R”“100R”“140R”“160R”調節所需轉速；按“Up”“Down”鍵可上下調節轉速，實施過濾集菌（應避免雙芯針管進氣濾膜被藥液浸濕，影響進氣）。
   2.6完成集菌后，若樣品含抑菌物質，用適當緩沖液清洗，清洗方法與集菌過程相同。
   2.7啟開培養基的鋁蓋，插針孔并。
   2.8摘下頂部空氣濾器開口的膠塞，將集菌培養器底部濾器開口塞上膠塞，用止血鉗依次開閉軟管，開啟集菌儀，將培養基泵入的集菌培養器。
   2.9用小夾子夾閉與培養器連接部的導管，留下5-6cm導管，檢出其余部分，并將開口端插入在空氣濾器開口上。
   2.10分別按規定進行培養，并觀察培養情況。
   2.11當更換檢品和完成過濾時，按下“Stop”鍵，儀器立即停止運行。
3.結束
   3.1關閉電源。
   3.2取下不銹鋼底座進行清洗。
4.注意事項
   4.1集菌儀必須有效接地。
   4.2集菌儀長期不用，應切斷電源。
   4.3集菌儀應置于平穩的操作臺面，其工作環境應避免振動和化學腐蝕。
   4.4若無菌室采用化學劑時，應將儀器置密封罩內，或搬出無菌室，以免損壞電子部件和腐蝕金屬配件。
   4.5應保持取樣針上的過濾膜干燥，氣流通暢，正常浸液。方法是在取樣針插入瓶裝流體樣品時，應先開機，然后倒轉容量瓶。
   4.6更換檢品或完成過濾時應停機，否則會使集菌培養器內產生過高的氣壓，膠塞脫離，影響使用。可摘下膠冒放氣，消除集菌培養器內的壓力。
   4.7若進液管內出現過多氣泡，應將泵速降低，并檢查氣濾膜是否被浸濕，若不能進液，則檢查進液針管是否暢通。
   4.8集菌儀運轉時切勿將手伸入轉軸內，待扣在后再開機。