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無菌檢測隔離器有不同的系統設計，可以按照標準化的設備制造，也可以根據無菌操作的空間，尺寸，具體要求等進行非標定做化設計。
MIS1650C采用正壓垂直單向流設計，滿足《中國藥典》中對隔離器需要為單向層流操作的要求。采用單向流設計極大程度地降低交叉污染發生的概率，并且層流的氣流分布均一性更好，極大程度保證過氧化氫滅菌效果。
系統內部無菌滅菌系統采用汽化過氧化氫滅菌系統。汽化過氧化氫滅菌系統不同于常規的濕熱蒸汽滅菌，這是一種干法滅菌技術，采用“閃蒸"的方式，能有效地穿透高效空氣過濾器，達到生物指示劑log6的微生物衰減，且不會發生任何形式的冷凝。
無菌檢測隔離器MIS1650C確保設備良好的密封性和內部的無菌保持度，保證了操作人員和運行環境的安全性。
系統高度集成，具備粒子計數器、微生物采樣器等環境監測設備，通過觸摸屏進行操作，根據客戶不同需求提供滅菌數據和環境監測數據報表的存儲、電子版本輸出或打印等功能。控制系統的設計可滿足良好自動化生產實踐指南（GAMP 5)，以及21 CFR Part11對電子記錄和電子簽名的要求。
無菌檢測隔離器MIS1650C內部全部采用大圓弧角設計，既能滿足清潔的要求，又可以避免邊角棱對人員造成傷害，做到滿足GMP的要求。
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