冷凍干燥機已經在化工、食品、材料、醫藥、生物制品等領域得到廣泛應用。真空冷凍干燥機(簡稱凍干機)，是實現冷凍干燥技術的設備，是一種結構比較復雜的機器，冷凍干燥機涉及到制冷、真空、熱工、機械、流體、電器控制和壓力容器等領域的知識。冷凍干燥機的自動控制系統在整體運行中發揮重要作用，下面我們來仔細分析一下。
許多冷凍干燥機帶有自動控制系統，并同時兼備有手動控制功能，但自動控制的方式上各制造廠之間有很大的差別，用戶必須弄清楚。
所謂冷凍干燥機的自動控制應該包括二個部分，一是冷凍干燥機的各設備按凍干工藝要求在規定的時間自動走停，二是凍干箱板層溫度按凍干曲線要求自動跟蹤，整個凍干進程不需要人工操作，當然如果需要也可人工干預。但有些冷凍干燥機的自動控制是不*的，僅能自動跟蹤凍干曲線，其余部分需人工操作。
有些冷凍干燥機的自動控制僅能到凍干結束，凍干結束之后的箱內壓塞、冷凝器除霜以及蒸汽消毒不能自動進行，需要人工操作，特別是蒸汽消毒部分，因涉及到許多閥門控制，人工操作比較麻煩，應該選擇自動消毒程序的冷凍干燥機。
有些冷凍干燥機的自動控制是使用微機，操作、編程方便，顯示的語言是凍干語言，還帶有熒光屏，打印機和軟盤，能同時儲存幾十個凍程序，每個程序內容可顯示，整個程序內容可由打印機打出。而有冷凍干燥機的自動控制使用的是一種儀表，操作、編程均較麻煩，可儲存的凍干程序也較少。
記錄儀表對凍機來說也是一個很重要的儀器，它能把整個凍干的實際過程真空地記錄下來，以便日后存查，記錄儀表大都采用多點記錄儀，它既能打點，又能直接進行文字記錄，還有數字顯示系統。用戶應了解清楚之后，根據具體情況選訂。
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