超景深顯微鏡突破景深的局限，通過強大的軟件功能，廣泛應用于觀察微生物，輔助探測，在電子，化工行業也有所應用，之所以能夠得到廣泛應用，是因為其具備有以下的功能。
1、 組織成分分析、相含量測量
自動識別組織成分、自動測量相含量、得出分析報告。常用于巖石、金相、孔隙分析、夾雜分析等。
例如：成分分析，根據相含量的分布，給出三角統計圖形，根據三角形分布判別種類。
2、 全自動顆粒分析與統計
提供功能強大的顆粒分析、統計工具。
自動識別顆粒、自動測量顆粒面積、粒度、圓度、卡規直徑、形態特征等大量參數。按照參數進行分類統計，給出統計柱狀圖和報告。
3、 強大的輔助探測工具
三維超景深顯微鏡提供強大的顆粒探測工具(包括魔術棒和顏色吸管)，方便用戶進行手動識別顆粒，觀察局部特征顆粒等應用。 能根據外形、顏色等特征，識別測量顆粒與組織。
4.景深全方面觀測系統
與傳統光學顯微鏡相比，可以實現20倍以上的大景深觀察;甚至用傳統顯微鏡不能全聚焦的凹凸大的樣品，可以清晰準確觀察到。
5.導航功能
三維超景深顯微鏡可在導航畫面中運用已經連接的圖像。點擊要觀測的位置，可自動移動位置。當前觀測視場以黃框顯示，載物臺移動后的視場以紅色框顯示，載物臺調整由此變的輕松簡單。此外，使用高倍鏡觀測時，可以立即了解觀測目標物要觀測的部分，這對于視場搜索來說便利。
6.實現超深度且高分辨率的觀察，不僅具備高性能，而且任何人都能簡單操作。從觀察到分折工作，縮短客戶的評價時間，大幅度提高品質。
7.實現光學顯微系統的20 倍以上的景深。即使是用顯微系統無法對準焦點的凹凸的大目標物也可正確地觀察。另外，還可大幅度削減對焦的觀察工時。
8.三維超景深顯微鏡手持式或固定在支架上便可隨心所欲地進行觀察。通過改變觀察的方向，任何現象都無法逃脫，可實現確實觀察。另外，還可大幅度縮短觀察的時間。
9.對比度差無法分辨或太暗而無法看清等問題可通過各種數碼處理來解除。根據圖解引擎，改善圖像后便可直接進行實時觀察。現象無一遺漏，可實現正確的觀察。
以上就是超景深顯微鏡所具備的一些強大功能，超景深顯微鏡是一種用于物理學領域的分析儀器，突破常規正立式顯微觀察的局限，創新的擺臂式設計，可對觀察樣品作全方面觀察。
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