單細胞分選在生物信息學中起到一個重要角色
閱讀:234 發布時間:2023-6-25
單細胞分選(SingleCellSorting)技術是一種可以將單個細胞從復雜的混合樣品中進行快速篩選和富集的高通量技術。該技術已經廣泛應用于生物信息學研究中,尤其在腫瘤、免疫學、發育生物學等領域起到了至關重要的作用。
在單細胞分選過程中,流式細胞儀被廣泛應用于實現對各類類型組成樣品中具有特定熒光或其他標志性抗原的單個活體細胞進行誘導及捕獲,并高效地回收目標基因組或轉錄組檢測所需數量。
通過這種方式獲取到大規模而又完整的布谷鳥圖譜(bird's-eyeview),我們就能夠更加全面準確地揭示每個調控區域對基因表達影響的精度與范圍。
除此之外,在當前越來越多地采取“全基因組”水平上進行數據挖掘時,利用該項技術篩選出人群內感染率較高者以及不同亞型間差異顯著性分析也變得更為便利和直觀。同時在檢驗致癌基因及其調控機制、研究分化過程和細胞信號傳遞通路等方面,單細胞分選也發揮了重要的作用。
但是在應用中,仍然存在一些限制和難以克服的技術問題。例如,在大樣品量與小樣品量之間做抉擇時會帶來不同模式的噪聲或誤差;同時,在測序過程中出現高達10-25%丟失率將會使得數據質量下降;此外還有成本高昂等問題需要考慮。
總體而言,盡管單細胞分選技術面臨著許多挑戰和困難,但它已經被證明是一個強有力的工具來深入理解生物信息學領域復雜流程。未來我們可以通過對該項技術進行持續改進與優化,并結合其他科研手段實現更加全面地研究方法論并為各類相關應用任務提供支撐。