通常實驗室產生的廢水包括多余的樣品、標準曲線和樣品分析的殘液、無效的儲存液和洗滌液以及大量的洗滌水。幾乎所有的常規分析項目都不同程度地存在廢水污染的問題。當然，不同成分的廢水處理方法也不同。確定污水性質才能確定實驗室污水處理方法。
1、有機廢水處理
有機廢水主要包括一些滴定劑、反應液和金屬消解液，包括氯仿、四氯化碳、二氧化硫等。其中，毒性較小的廢水可用水稀釋后直接排放，其他有毒有害廢水可通過蒸餾水、回用或其他處理方法處理。
2、無機廢水處理
無機廢水主要包括汞、鋅、銅、鎘、鎳等重金屬、重金屬絡合物以及含有大量酸堿的廢液。
3、含酸、堿廢水的處理
對于含酸或堿的實驗廢水，通常根據酸堿原理進行中和及后處理。在治療過程的總結中，要注意操作，采用少量多次。攪拌時，要將兩種不同PH值的廢水混合。一般可以通過調節溶液的pH值到7來進行相應的排放。
4、特殊廢水處理
根據放射性核素的半衰期，含放射性核素的廢水可分為長壽命和短壽命。長壽命放射性核素和高濃度廢水要分幾種方式儲存，達到一定量后，要進行凈化處理。短壽命放射性核素廢水應采用貯存法處理，且必須消毒。經處理后，符合排放標準規定的要求，方可排放。
5、綜合廢水處理
實驗室污水處理方法采用“水質均化+中和過濾→中和混凝→置換內電解→生物吸附池→沉淀池、清水池”工藝進行處理。在廢水處理中，為保護pH值在線控制系統，采用中和過濾技術，保證酸堿廢水穩定達標，節省化學藥品。采用組合填料實現污泥固定化；消毒工段采用先進的臭氧發生器進行消毒，污泥消化采用脈沖布水器，實現污泥減量。該工藝能分解復雜有機物，并能穩定處理實驗廢水中產生的化學物質對廢水的影響。
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