多功能酶標儀指擁有多種檢測模式的單體臺式酶標儀。通常某些多用途型酶標儀支持標準1cm立式比色皿插槽，不僅僅微孔板可進行吸光度（Abs)、熒光強度(FI)、時間分辨熒光（TRF)、熒光偏振（FP)、和化學發光（Lum)檢測，甚至1cm立式比色皿也可進行除吸光度檢測外的熒光強度和化學發光檢測。
酶標儀基于濾光方式的不同可分為濾光片式的酶標儀和光柵式酶標儀。濾光片式酶標儀采用濾光片來進行波長的選擇，酶標儀內置濾光片輪，可選擇試驗所需的不同波長的濾光片來進行分光，光源發出的全波譜光經過濾光片后，大部分被過濾，只剩下濾光片本身允許的波長通過，這樣就可就通過濾光片來獲得特定的波長。濾光片輪一般包含4-6塊濾光片，通過選擇不同的濾光片可獲得不同的波長，但是獲得的波長都是固定的，受到一定的限制，不能獲得任意所需的波長，而且更換濾光片價格比較昂貴。一般波長固定的濾光片有405，450，490，630nm。
光柵式酶標儀雖然才出現短短十余年，但是發展非常迅猛，已經是主流的酶標儀.它采用光柵進行分光，光源發出的全波譜光線經過光柵后，通過光柵上面分布的一系列狹縫的分光，就可以獲得任意波長的光，波長連續可調，一般遞增量為1nm，同時具有帶寬可選的功能。光柵式酶標儀使用方便靈活，可以通過軟件選擇任意波長的光，而且可以進行全波長的掃描,通過全波長掃描可以獲得未知樣品的吸收峰，從而可以達到檢測未知樣品的目的，在實驗室中很受歡迎，可以進行更多實驗的檢測，因此在國內的普及程度很高。
另外根據通道的個數，可以將酶標儀分為單通道和多通道兩種類型，單通道又有自動和手動兩種之分。
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