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　生物安全柜內的所有物品，包括設備，都應在工作完成之后進行表面去污處理并從柜內取出，因為殘留的培養介質可能會提供微生物的生長條件。安全柜的內表面應在每次使用前與使用后進行去污處理。要用消毒劑擦拭工作臺表面及內壁面，使用的消毒劑應能殺死柜內可能存在的所有微生物。一天工作結束時，應進行后表面去污處理，即對工作臺、各個側面、背面及玻璃的里面進行全面擦拭。可以使用70%酒精，這種對目標生物有效的消毒劑。如使用有腐蝕性的消毒劑，則要用滅菌水進行二次擦拭。建議工作柜在清潔、消毒時處在工作狀態。如果其未處在工作狀態，則應運行5分鐘，以便在安全柜關閉前將其中的氣體清除掉。

　　生物安全柜的去污處理

　　對1級和2級生物安全柜的去污，是將適量的低聚甲醛(使柜內空氣中的低聚甲醛的終濃度為80%)置于電熱盤或煎鍋上(從柜外控制)。另將一個放有比低聚甲醛多10%的碳酸氫的電熱盤或煎鍋也放在柜內(在柜外控制)。這第二個容器上應帶蓋，這個蓋子可以從遠處取下來(例如系在一根線上，線可以從柜外拉動)。這樣可以使提前中和的低聚甲醛達到小。如果相對溫度低于70%，有熱水的開口容器。如果沒有前隔板，則要用生型塑料擋板，將其用膠帶粘在前臉，確保不會有氣體漏入房間。當盤內的低聚甲醛已全部揮發或開關已打開1小時后，將開關關閉。將安全柜放置一整晚不得觸動。然后將第二個盤子的蓋移開并打開其開關，碳酸氫氨開始揮發。這時，關閉盤子的開關，讓安全柜開始工作，使碳酸氫氨氣循環1小時。然后可以取下前隔板(或塑料擋板)，安全柜即可使用。