賽默飛紅外顯微鏡是通過顯微鏡觀察被測樣品的外觀形態或物理微觀結構的基礎上直接測試樣品某特定微小部位的化學結構，得到該微區物質的高質量紅外譜圖。它結合了微區觀察和紅外測量功能。
賽默飛紅外顯微鏡的特點：
紅外顯微鏡一般采用折返式光路系統，紅外光通過光闌，照射到樣品后通過反射，又經過同一個光闌到達檢測器進行分析，得到的光譜只包含所需的樣品信息，這樣可以收集細微樣品而不受周邊基質光譜的影響，也具有高分辨率，可通過使用對比增強的變化來收集樣品的高質量視覺圖像，從而可以用于更多分析。
另外在測試時不會損壞樣品，無需特殊制樣，可對一些樣品少、且不能破壞的微量的微區樣品進行檢測，這是傳統的紅外光譜分析技術所不能解決的。也具有快速檢測，無污染，不用進行前處理等特點。
賽默飛紅外顯微鏡的部分應用領域如下:
1.應用于研究物質的分子振動光譜，用于有機合成產物及其中間體、天然產物結構測定結構測定及定量分析，鑒別。
2.高分子材料、復合或填充高分子材料、口腔材料、珠寶、礦物等材料的成分研究及表面結構分析。
3.食品、表面活性劑等中的有機成分、無機成分的分析。
4.化學反應動力學的研究，連續監測不同階段物質的結構變化。
5.材料微區、材料污染物或微量樣品的成份分析。
6.氣體的成份分析。
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