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多種儀器聯(lián)用新技術(shù)-二手HPLC-MS/MS高液相質(zhì)譜聯(lián)用是現(xiàn)在 藥物代謝研究 分析的趨勢，歐美國家已廣泛采用，成本低效益高，對食品，環(huán)境，醫(yī)療等方面都有重要分析和測定。
藥物代謝與藥物動力學研究技術(shù)上的重大進展是二手LC-MS-MS的使用，電噴霧（ESI）和大氣壓化學電離（APCI）以及大氣壓光電離（APPI）是其主要的離子源，由于具有高靈敏度（ng/ml~pg/ml），高選擇性（檢測特定的碎片離子）、高效率（每天可檢測幾百個生物樣品和對藥物結(jié)構(gòu)的廣泛適用性，對液態(tài)樣品和混合樣品的分離能力高，可通過二級離子碎片尋找原型藥物并推導其結(jié)構(gòu)，LC-ESI-MS-MS已廣泛地應(yīng)用于藥物代謝研究中一期生物轉(zhuǎn)化反應(yīng)和二期結(jié)合反應(yīng)產(chǎn)物的鑒定、復雜生物樣品的自動化分析以及代謝物結(jié)構(gòu)闡述等，已在世界上大型制藥企業(yè)中取代HPLC而占據(jù)了主導地位，其測試的樣品量占總量的70%以上。
天然產(chǎn)物天然藥物的研究
目前中藥開發(fā)研究有兩條途徑。一條途徑是從單一植物中提取一種有效成分(單體化合物)或提取物開發(fā)成新藥。另一途徑則是中藥復方制劑的開發(fā)研究。 采用現(xiàn)代多種儀器聯(lián)用新技術(shù)，特別是高效液相色譜/質(zhì)譜/質(zhì)譜聯(lián)用(二手HPLC-MS/MS)，可對其十幾種乃至幾十種化學成分進行指紋圖譜分離鑒定。再從指紋圖譜中選擇四、五種指標成分(有效成分或特征成分)進行定量，可以確定出簡化的指紋圖譜和指標成分，又是合理的中藥復方質(zhì)量控制的方法，是研究中藥復雜體系，尤其是復方的有力工具。國內(nèi)外很多學者已進行了復方丹參、清開靈、瀉心湯、人參或黨參制劑等中藥中的主要成分的分析。
臨床診斷和疾病生物標志物的分析
歐美等目前已廣泛采用二手HPLC/MS/MS法用于臨床診斷以及疾病生物標志物的研究、檢測，具有專一性好、靈敏度高、成本低、分析快速，經(jīng)濟效益可觀等特點。目前可進行新生兒遺傳疾病篩選（PKU、MCAD等四十種左右）、新生兒性激素變異的檢測、男女激素的監(jiān)測、老年癡呆癥的早期診斷、抗排異藥物的檢測、磷酸脂的檢測、血紅蛋白變異檢測、糖化血紅蛋白（糖尿病早期檢測）、某些心臟病、癌癥疾病篩查如乳腺癌等等（Biomarker法、通過鑒定DNA損傷程度測定）、藥物劑量監(jiān)測、藥物相互作用監(jiān)測、地區(qū)性突發(fā)性中毒病人的毒物檢測等。
殘留、法醫(yī)學和環(huán)境樣品測定
專家指出，中國入世后，食品工業(yè)大的問題就是"安全壁壘"，這將給中國的進出口和國內(nèi)企業(yè)帶來很大的威脅。美國食品與藥品管理局 (FDA)、歐盟、日本、韓國等主要貿(mào)易國和地區(qū)公布了在進口動物源性食品中禁止使用的藥物名單，提高了高*。這就要求中國加強農(nóng)、畜、水產(chǎn)品中的農(nóng)藥、獸藥等殘留的控制和檢測。
同樣隨著人類對生存環(huán)境的倍加關(guān)注，要求對環(huán)境中各種污染物、有害或有毒物以及法庭科學中毒物、濫用藥物等進行更加嚴格的監(jiān)控。而配以ESI、APCI和APPI離子化技術(shù)的二手LC/MS/MS以分析速度快、靈敏度高、特異性好等特點廣泛應(yīng)用與殘留和毒物分析。目前已成功地進行數(shù)百種農(nóng)藥、獸藥、抗生素類殘留和毒物、毒素如氯霉素、磺胺類、硝基呋喃類、多環(huán)芳烴等等化合物的檢測。