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技術(shù)文章

轉(zhuǎn)化細(xì)胞時空和功能變化

閱讀:284          發(fā)布時間:2018-6-21

轉(zhuǎn)化細(xì)胞應(yīng)用研究具有廣泛的前景,包括癌癥或心臟病治療、組織,以及專門針對個人遺傳的高度個性化藥物。但這些應(yīng)用面臨類似的障礙:干細(xì)胞計量工具的開發(fā)具有很大的挑戰(zhàn)性,導(dǎo)致各類新型干細(xì)胞相關(guān)產(chǎn)品的安全性、有效性及高質(zhì)量難以確定。因此,科學(xué)家們一直在試圖解決這些問題。

美國技術(shù)研究院(NIST)近日發(fā)布一款新的圖像分析工具,結(jié)合錄像和高功率計算,使得人們可以更加接近評估、理解和量化用于相關(guān)療法或產(chǎn)品的細(xì)胞群特征。該工具名為網(wǎng)頁圖像處理管道(簡稱WIPP),類似地圖應(yīng)用程序。通過該工具,細(xì)胞培養(yǎng)物被分成真實的位置,可以通過非常像GPS點或地理地圖應(yīng)用來探索和應(yīng)用。WIPP還允許使用者檢查從任何角度觀察他們選擇的培養(yǎng)皿中發(fā)生的情況。

跟蹤單個活體干細(xì)胞成像研究比較簡單:使用現(xiàn)有工具(如視頻顯微鏡)拍攝固定的干細(xì)胞,運行鏡頭并觀察隨時間推移細(xì)胞的情況。但如果有成千上萬的細(xì)胞,并且拍攝足夠的圖像以捕捉每個細(xì)胞的運動和變化,這就需要很多電腦。例如,5天三次實驗可以產(chǎn)生等于1TB的數(shù)據(jù)集,筆記本電腦或臺式機系統(tǒng)硬盤區(qū)上難以承擔(dān)大量數(shù)據(jù)的處理工作。

WIPP利用服務(wù)器的計算能力和WEB界面的靈活性避開了這個問題。研究人員將數(shù)據(jù)上傳到服務(wù)器中,服務(wù)器執(zhí)行部分計算操作,另一部分則通過瀏覽器由臺式機來執(zhí)行。在WIPP系統(tǒng)中,可以在各種地圖中瀏覽,并訪問培養(yǎng)皿中的不同位置,還可以隨時發(fā)現(xiàn)每個位置發(fā)生的情況以及轉(zhuǎn)化細(xì)胞的生長變化。

WIPP結(jié)合了圖像背后的計算,提取分析數(shù)據(jù)以匹配實驗的每個視圖,允許用戶收集關(guān)于這些指標(biāo)的形狀、大小、紋理特征、熒光強度、對比度以及變化率的關(guān)鍵計量值,并且可以分析不同時空每個細(xì)胞群內(nèi)的集落情況。研究人員還可以使用WIPP系統(tǒng)追溯實驗中的計算情況。

 phospho-A Raf (Ser214) 抗人肝細(xì)胞單克隆抗體/肝細(xì)胞特異性抗原抗體

 Phospho-A Raf (Ser299) 抗普通大腸埃希菌菌體蛋白抗體

 Phospho-A Raf (Tyr301/302) 抗納曲酮抗體IgG

 phospho-Acinus(Ser1180) 抗利尿激素/血管升壓素抗體

 Phospho-Ack1(Tyr284) 抗菌肽/天蠶素抗體

 Phospho-Ack1(Tyr859/860) 抗核仁纖維蛋白抗體

 phospho-ADRB2 (Ser261) 抗表面S蛋白抗體

 phospho-Afadin(Ser1718) 抗Rap1A抗體
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