一、細胞交叉污染
另外，還會出現細胞交叉污染的情況。實驗人員經常會遇到多種細胞同時培養的“多線操作"。所用的器具或者液體一旦混雜使用，就容易導致細胞交叉污染，一個培養體系里出現兩種不同的細胞，會使細胞生長狀態、形態發生變化、互相抑制，最終死亡。
二、化學污染
一些外源化學物質會對細胞產生或大或小的影響，此類影響可能抑制細胞生長，也可能加速細胞生長，但這些都是不可控的。
這些化學污染物來源廣泛：用過的器具未清洗干凈；實驗時小手一抖試劑加多了（比如氨基酸等）；使用的添加劑純度不達標等等。
因此，在挑選試劑時，要購買在正規產品，盡量使用一次性滅菌器具，注意實驗操作規范。
三、物理污染
物理污染通過影響細胞培養體系中的化學成分，來影響細胞生長。
簡單來說，就是一些物理因素導致培養基中一些成分發生變化，而引起整個細胞培養環境變質。溫度、射線、震動、輻射，上述這些都有可能影響細胞導致代謝紊亂，導致細胞生長受阻，嚴重時細胞也會直接“掛掉"。
所以，在規劃細胞培養室以及實驗操作時，需要遵守規范，減少物理因素對細胞培養的影響。
細胞培養箱擺放在恒溫環境中，周圍環境不應存在可能產生機械振動的儀器（這里點名：離心機）；培養試劑儲存處要避免各類射線照射以及放射性物質；細胞房的冰箱應選擇非透明門，如果是玻璃門要進行遮光處理；使用培養基要提前預熱。
生物實驗是一個嚴肅且嚴謹的過程，失之毫厘差之千里，稍有不慎，就無法得到令人信服的可靠數據。因此，防患于未然，在實驗前和實驗過程中，實驗人員都應嚴格遵守實驗規范，盡可能避免污染的發生。
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