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RIG-I 信號通路

時間:2023/8/14閱讀:541
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RIG-I 配體

• 5’ppp-dsRNA

5’ppp-dsRNA 是一種5’三磷酸雙鏈RNA,通過一個由19個核酸分子通過磷酸二酯鍵聚合成的5`三磷酸單鏈RNA和其非三磷酸互補鏈雜交形成。5’ppp-dsRNA的序列可以通過篩選各種序列突變體確定。未加帽的5’三磷酸雙鏈RNA能夠被RIG-I特異性識別。

• 3p-hpRNA

3p-hpRNA是通過體外轉錄甲型流感病毒(H1N1)序列而產生的5’三磷酸發夾RNA。這個有87個核酸分子的RNA寡核苷酸含有未加帽的5`三磷酸酯末端和雙鏈片段,它們是RIG-I識別的特征結構。3p-hpRNA是RIG-I的一種有效并特異性的激動劑。


RIG-I/MAVS 報告基因細胞

InvivoGen欣博盛生物提供一系基于人源肺癌細胞株A549,小鼠巨噬細胞RAW和人源胚腎細胞HEK293穩轉細胞系,助力RNA感受器RIG-I信號通路的研究。這些細胞系包括RIG-I或MAVS基因的敲除細胞株(衍生自A549或RAW細胞系)或者RIG-I基因的過表達細胞株(衍生自HEK-293細胞系)。

• A549-Dual™

• A549-Dual™ KO-RIG-I

• A549-Dual™ KO-MAVS    

• RAW-Lucia™ ISG

• RAW-Lucia™ ISG KO-RIG-I

• RAW-Lucia™ ISG KO-MAVS

• HEK-Lucia™ Null

• HEK-Lucia™ RIG-I



描述


所有的RIG-I/MAVS報告基因細胞系均表達一個含有分泌型熒光素酶基因ISG(干擾素刺激基因)誘導型構件。活化RIG-I/MAVS信號通路可誘導ISG啟動子的活化并產生熒光素酶,該酶存在于細胞上清并能夠通過熒光素酶檢測試劑QUANTI-Luc™檢測定量。源于A549的細胞攜帶一個額外的NF-κB誘導表達分泌型堿性磷酸酶(SEAP)基因構件,該酶的活性能夠通過SEAP檢測試劑QUANTI-Blue™檢測定量。

這些RIG-I/MAVS報告基因細胞株攜帶Zeocin™單抗性基因或Zeocin™和Blasticidin(參見最后一頁)雙抗性基因。


結果


使 用 RIG-I激動劑,復合了 LyoVec™的 5’ppp-dsRNA和3p-hpRNA刺激A549-Dual™和RAW-Lucia™ ISG細胞系,ISG應答顯著。在A549-Dual™細胞中3p-hpRNA激動性強度明顯高于5’pppdsRNA,30 ng/ml的3p-hpRNA復合物活化信號已明顯高于300 ng/ml 5’ppp-dsRNA的復合物。相反,在RIG-I-KO或MAVS-KO細胞株中應答消失。使用RIG-I配體刺激HEK-Lucia™對照細胞時ISG反應很弱。而在HEK-Lucia™ RIG-I細胞中,由于RIG-I基因的組成型過表達導致這種應答尤為強烈。同樣,當使用3p-hpRNA和5’ppp-dsRNA時觀察到更高水平的ISG應答。在衍生自A549的細胞株中NF-κB對于RIG-I配體的反應跟ISG應答是相似的,雖然前者更弱一些(參考網站數據)。

RIG-I 信號通路


ISG對RIG-I配體的反應:使用300 ng/ml的5’ppp-dsRNA或30 ng/ml的3p-hpRNA刺激衍生自A549的細胞;使用1 μg/ml 5’ppp-dsRNA或3p-hpRNA刺激衍生自RAW和HEK293的細胞。經過孵育過夜,可使用QUANTI-Luc™檢測上清中Lucia熒光素酶活性的相對光單位(RLUs)以測試ISG的反應。


Product
QuantityCat.code
A549-Dual™ cells3-7 x 10^6 cellsa549d-nfis
A549-Dual™ KO-MAVS cells3-7 x 10^6 cellsa549d-komavs
A549-Dual™ KO-RIG-I cells3-7 x 10^6 cellsa549d-korigi
RAW-Lucia™ISG cells3-7 x 10^6 cellsrawl-isg
RAW-Lucia™ISG-KO-MAVS cells3-7 x 10^6 cellsrawl-komavs
RAW-Lucia™ISG-KO-RIG-I cells3-7 x 10^6 cellsrawl-korigi
HEK-Lucia™ Null cells3-7 x 10^6 cellshkl-null
HEK-Lucia™ RIG-I cells3-7 x 10^6 cellshkl-hrigi
5’ppp-dsRNA25 µgtlrl-3prna
3p-hpRNA25 µgtlrl-hprna


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PRODUCTDESCRIPTIONCAT. CODE
QUANTI-Luc™Luciferase detection reagentrep-qlc1
QUANTI-Blue™SEAP detection reagentrep-qb1



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