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HB190313測序數(shù)據(jù)不好？是不是建庫出了問題？！——從測序數(shù)據(jù)看文庫構(gòu)建高通量測序中的文庫構(gòu)建指的是在DNA兩端連接特定的接頭從而使其符合測序平臺要求的過程，在高通量測序過程中，文庫質(zhì)量直接影響終測序數(shù)據(jù)的質(zhì)量，打個比方，如果文庫上機測序的濃度很低，樣本在FlowCell上擴增所形成的DNA樣本簇就會很少，測序數(shù)據(jù)量也將減少，這就可能導(dǎo)致測序失敗，所以我們說文庫的質(zhì)量控制和質(zhì)量評估也是NGS中的關(guān)鍵步驟。文庫如何質(zhì)控？評估文庫質(zhì)量的方法有哪些？n文庫質(zhì)控：文庫在上機之前都有會進行質(zhì)量檢測，質(zhì)
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這有一份FFPE樣本建庫的檔案，還不趕緊Pick?什么是FFPE？FFPE（Formalin-FixedａndParrffinEmbedded），即福爾馬林固定石蠟包埋樣本。由于這種處理方法能夠較長時間地保存組織或制備檢驗所需的組織標本，所以在臨床病理檢驗、腫瘤基因檢測中應(yīng)用廣泛。在世界范圍內(nèi)，大約有數(shù)十億份組織樣品保存在醫(yī)院或者組織樣品庫中，其中絕大多數(shù)是使用福爾馬林固定石蠟包埋的方法處理的樣品。FFPE樣本通常代表了珍貴且來源廣泛的生物醫(yī)學(xué)研究材料，為闡明疾病機制、回顧性研究等提供了寶貴的資
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系統(tǒng)介紹鏈脲佐菌素（STZ）誘導(dǎo)的糖尿病疾病模型
翊圣生物提供高成功率糖尿病建模用STZ：純度≥98%（HPLC測定）。產(chǎn)品名稱貨號規(guī)格*（元）Streptozocin鏈脲佐菌素60256ES60100mg156.00Streptozocin鏈脲佐菌素60256ES76500mg386.00Streptozocin鏈脲佐菌素60256ES801g676.00文章包含以下知識點1.STZ誘導(dǎo)糖尿病模型的構(gòu)建標準SOP2.STZ誘導(dǎo)糖尿病模型建模效果評估指標3.STZ誘導(dǎo)糖尿病模型的失敗原因解析4.STZ誘導(dǎo)小/大鼠死亡率高的原因解析5.糖尿病建模 -
什么是DNA甲基化DNA甲基化（DNAmethylation）是DNA化學(xué)修飾的一種形式，能夠在不改變DNA序列的前提下改變遺傳表現(xiàn)。DNA甲基化是指在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶的作用下，在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共價鍵結(jié)合一個甲基基團。DNA甲基化的結(jié)果，一般是使甲基化位點的下游基因表達量變少。圖1：DNA甲基化原理圖為什么研究DNA甲基化DNA甲基化是早發(fā)現(xiàn)的基因表觀修飾方式之一，可能存在于所有高等生物中。DNA甲基化在維持細胞正常功能、傳遞基因組印記、胚胎發(fā)育、腫瘤發(fā)生等方面發(fā)揮重要作
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小分子化合物專題一、信號通路信號通路是指當細胞里要發(fā)生某種反應(yīng)時信號從細胞外到細胞內(nèi)傳遞了一種信息，細胞要根據(jù)這種信息來做出反應(yīng)的現(xiàn)象。信號通路（signalpathway）的提出早可追溯到1972年，不過當時被稱為信號轉(zhuǎn)換（signaltransmission）。1980年M.Rodbell在一篇綜述中提到信號轉(zhuǎn)導(dǎo)（signaltransduction），此后該概念就被廣泛使用了。信號通路是指能將細胞外的分子信號經(jīng)細胞膜傳入細胞內(nèi)發(fā)揮效應(yīng)的一系列酶促反應(yīng)通路。這些細胞外的分子信號（稱為配體，l
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新品速遞---“一步法”建庫試劑盒-----HieffNGS®OnePotDNALibraryPrepKitforIllumina®?產(chǎn)品背景：DNA文庫的構(gòu)建是二代測序前期的核心環(huán)節(jié)。目前市面上推廣的建庫試劑盒主要有常規(guī)建庫試劑盒以及轉(zhuǎn)座酶法快速建庫試劑盒。常規(guī)試劑盒需要購買單獨的片段化模塊或者采用機械法進行片段化，機械法片段化對DNA分子有一定的損傷，影響文庫質(zhì)量。轉(zhuǎn)座酶法試劑盒都是針對特定InputDNA量的樣本進行建庫，并且存在一定的偏好性，影響測序質(zhì)量。HieffNGS®OnePotD
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如何定量低豐度目的基因的表達（含詳細解決方法）有時候，qPCR實驗會成為阻礙你課題順利開展的強勢攔路虎！看似簡單的基因表達量差異驗證，當遇到低豐富表達的基因時，也許就舉步維艱。模板獲取困難導(dǎo)致的RNA提取量少或RNA質(zhì)量不佳，即使選蕞佳的試劑、篩選出良好的引物，也有可能qPCR定量得到的內(nèi)參基因CT值在18-20個cycle，而目的基因在31-35個循環(huán)。遇到這種情況，你是怎么解決的呢？qPCR在低豐度表達基因定量中的局限性基因的豐度是指基因在基因組中的拷貝數(shù)。可分為高豐度，中等豐度和低豐度。低
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NGS測序技術(shù)近年來得到了巨大發(fā)展，2017年摩根大會上，Illumina重磅推出NovaSeq測序儀，NovaSeq可以2天產(chǎn)生2Tb數(shù)據(jù)，通量是10年前GenomeAnalyzer的2000倍。測序通量的大幅增加，意味著更多的樣本混合上機，這樣的話我們?nèi)绾卧诿Ｃ?shù)據(jù)中找到對應(yīng)樣本匹配的數(shù)據(jù)呢？人們想到了一種在文庫構(gòu)建時在接頭上添加“接頭暗號”的方法，在測序完成之后根據(jù)“接頭暗號”對樣本進行分離。這里的接頭暗號就是樣本標簽“Index/Barcode”。本文將以建庫過程中要添加的接頭為核心，對
