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醫(yī)療機構(gòu)高通量基因測序?qū)嶒炇以O(shè)計布局建設(shè)
高通量測序檢測實驗室也叫NGS實驗室,是以高通量測序技術(shù)為檢測手段,來完成臨床疾病篩查、診斷或輔助診斷、腫瘤基因突變檢測等項目。
由于NGS技術(shù)對所檢測的核酸模板進行大量擴增,容易出現(xiàn)實驗室污染導(dǎo)致檢測結(jié)果不準(zhǔn)確;且NGS實驗要求高、影響因素多,實驗過程處理不當(dāng)也會導(dǎo)致檢測結(jié)果異常。因此一個嚴(yán)格有序、規(guī)范的NGS實驗室是非常必要的。
醫(yī)療機構(gòu)高通量基因測序?qū)嶒炇以O(shè)計布局建設(shè)
高通量測序?qū)嶒炇以O(shè)計要求
按照衛(wèi)計委《臨床基因擴增檢驗實驗室工作規(guī)范》的要求,原則上臨床基因擴增檢驗實驗室應(yīng)當(dāng)設(shè)置以下區(qū)域:試劑儲存和準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴增區(qū)、擴增產(chǎn)物分析區(qū)。這4個區(qū)域在物理空間上必須是相互獨立的,各區(qū)域無論是在空間上還是在使用中,應(yīng)當(dāng)始終處于分隔狀態(tài),不能有空氣的直接相通。根據(jù)使用儀器的功能,區(qū)域可適當(dāng)合并。例如使用實時熒光PCR儀,擴增區(qū)、擴增產(chǎn)物分析區(qū)可合并;采用樣本處理、核酸提取及擴增檢測為一體的自動化分析儀,則標(biāo)本制備區(qū)、擴增區(qū)、擴增產(chǎn)物分析區(qū)可合并。
臨床基因擴增檢驗實驗室的空氣流向可按照試劑儲存和準(zhǔn)備區(qū)→標(biāo)本制備區(qū)→擴增區(qū)→擴增產(chǎn)物分析區(qū)進行,防止擴增產(chǎn)物順空氣氣流進入擴增前的區(qū)域??砂凑諒脑噭﹥Υ婧蜏?zhǔn)備區(qū)→標(biāo)本制備區(qū)→擴增區(qū)→擴增產(chǎn)物分析區(qū)方向空氣壓力遞減的方式進行??赏ㄟ^安裝排風(fēng)扇、負(fù)壓排風(fēng)裝置或其他可行的方式實現(xiàn)。如果條件允許,建議將NextSeq CN500測序儀所在的測序室工作溫度控制在18-22℃,濕度控制在65%以下。
高通量測序?qū)嶒炇业膹婋姟⑷蹼娦枨?/span>
弱電:
建議每個房間預(yù)留1網(wǎng)絡(luò)端口、1電話端口。并為高通量測序?qū)嶒炇遗鋫洫毾?M以上的網(wǎng)絡(luò)。
強電:
用電器分布大致如下:
試劑準(zhǔn)備間:冰箱、冰柜等;總功率≤5kw
樣本制備間:高速離心機、低速離心機、垂直混勻儀等;總功率≤10kw
擴增間:PCR儀、熒光定量PCR儀等;總功率≤5kw
測序間:UPS電源(測序儀、服務(wù)器都與UPS電源連接);UPS接入功率6KW
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