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質(zhì)粒提取
質(zhì)粒提取時應(yīng)該注意:1、搖菌時間:過液培養(yǎng)是一個普遍接受的概念,而且適合大部分情況。如果出現(xiàn)了問題,調(diào)整培養(yǎng)時間會有幫助:Nick 多,則增加培養(yǎng)時間;酶切出現(xiàn)問題,則減少培養(yǎng)時間。
2、起始菌體量:大家習(xí)慣說“從多少 ml 菌液中抽提質(zhì)粒",但要養(yǎng)成每次都觀察菌體量的習(xí)慣,因為質(zhì)粒畢竟是在菌體中,而且,抽提質(zhì)粒所用的試劑量,都只與菌體量有關(guān)。
3、菌體的懸浮:如果沒有懸浮菌體,則殘留的菌體團(tuán)塊在溶液 II 加入后,變成一個外圍裂解,往里不裂解,中間沒有裂解的團(tuán)塊。這個團(tuán)塊在溶液 III 加入后,會有一部分蛋白質(zhì)繼續(xù)存在于溶液中,成為蛋白質(zhì)殘留的大根源。
4、使用相對過量的試劑:這是適合核酸抽提的建議。試劑相對過量的好處是:穩(wěn)定性好,純度高,操作更簡單。如果認(rèn)為這樣不經(jīng)濟(jì),就少用一點菌體。
5、裂解時間:加入溶液 II 后,混勻,體系好能立即變得清澈。體系如果變得清澈了,馬上加入溶液 III 中和。如果體系不馬上變清澈,下次少用一點菌液,或者多用一點溶液。如今的質(zhì)粒設(shè)計得越來越復(fù)雜了,奇怪的現(xiàn)象也越來越多,而的奇怪現(xiàn)象,多與裂解時間有關(guān)。
6、中和的操作:在1.5ml離心管中加入溶液 III 后,先顛倒兩次,使管底朝上,用指頭彈擊管底數(shù)次,再顛倒混勻。效果非常好。
7、中和后的離心去蛋白:要將蛋白質(zhì)離心下去。如果發(fā)現(xiàn)離心后仍然有蛋白質(zhì)漂浮在液面,繼續(xù)離心的效果并不好;而將上清倒入另外一個離心管中,再離心,效果要好許多。
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