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高質(zhì)量RNA提取條件之二

2017-8-10 閱讀(2958)

1.選擇好的RNA分離方法

現(xiàn)有眾多的RNA分離方法也許令人難以取舍。目前簡(jiǎn)單也是安全的方法是柱式分離,如RNApure 因?yàn)椴僮骱?jiǎn)單,時(shí)間短,純度高而受到大家的喜愛,RNApure不需要DNA酶消化DNA,節(jié)省了時(shí)間,避免RNA的降解,從而提高了產(chǎn)量;相對(duì)非柱式分離(如TRIZOL),去除蛋白及其他雜質(zhì)干凈,提高了純度,對(duì)于細(xì)胞、組織、一般植物均非常適合。植物RNA的提取比較難抉擇,植物RNA提取受酚、多糖、蛋白雜質(zhì)、次生代謝物含量的影響,一般用TRIZOL提取純度不高,而且很多植物用TRIZOL提取不出來。這時(shí)候可以選擇多糖多酚植物總RNA提取試劑盒(水仙、辣椒、胡蘿卜、玉米、百合、小麥、西紅柿、花菜、油菜等)和通用植物RNA提取試劑盒(適合絕大多數(shù)植物提取,包括:蘋果、葡萄、草莓、香蕉、龍眼、荔枝、草坪植物、松樹、杉樹、白樺、紫松果、彩葉草、一品紅、夾竹桃、垂葉榕、紫羅蘭、月季、天竺藍(lán)、牽牛花等);非常值得一提的是血液(包括血清、血漿、腦脊液、其他液體)RNA的提取用TRIZOL和紅細(xì)胞裂解的方法效果都不好,紅細(xì)胞裂解液不含有RNA酶的抑制成分,這個(gè)過程RNA很容易降解,推薦使用TRIpure LS 或者血液總RNA提取試劑盒。

2.消除環(huán)境RNase的污染

為了得到完整的、高品質(zhì)RNA,在整個(gè)RNA制備過程中,當(dāng)RNA離開強(qiáng)蛋白變性劑(如離液裂解液或酚)的保護(hù)時(shí),避免引入新的RNase污染就非常關(guān)鍵。由于RNase存在,所以與純化的RNA接觸的每一樣?xùn)|西都是無RNase污染的。的表面,包括移液器、工作臺(tái)、玻璃器皿和制膠設(shè)備,都用表面去污凈化溶液如RNase噴霧清除劑 來處理過,去除各種溶液或者反應(yīng)緩沖液中可能存在的RNase污染,可以用RNAsafe。一直使用無RNase的槍頭、試管和阿溶液,手套也應(yīng)經(jīng)常更換。

 3.提取好的RNA如何儲(chǔ)存

如果只是短期儲(chǔ)存,重懸的RNA應(yīng)放置于-20°C;如果是長(zhǎng)期儲(chǔ)存的話,就應(yīng)該放置于-80°C。盡管重懸于水或緩沖液中的RNA也可以儲(chǔ)存在-80°C,但保存RNAlong中的RNA沉淀則更加穩(wěn)定,可以長(zhǎng)期保存。我們推薦將RNA溶液分裝在幾支管中。這會(huì)避免反復(fù)凍融損傷RNA,并預(yù)防偶然的RNase污染。

4.使用正確的細(xì)胞或組織儲(chǔ)存條件

在樣品用液氮瞬間凍結(jié)之后,應(yīng)該儲(chǔ)存在-80°C,千萬不能解凍。即使是置于含有胍鹽的裂解液中作勻漿前的短暫解凍,也會(huì)導(dǎo)致RNA的降解和損失。瞬間凍結(jié)的組織應(yīng)該先在超低溫條件下先研磨成粉,然后置于裂解液中進(jìn)行勻漿。



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