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DAN數據分析

時間:2016/7/27閱讀:2498
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DAN數據分析

     數據分析是個牽涉面較廣的問題。不同類型的實驗結果,有不同的分析方法;同一類型的實驗,也有不同的分析方法。如對DNA直方圖的定量似合分析,上有7大類計算機似合程序。在此,我們不可能對各種分析方法一一介紹,而只是介紹某些典型方法。

    數據分析方法可分成非參數方法和參數方法兩大類。非參數方法對顯示的圖形不需作任何假定,也不要數學模型。有時,這個方法很直觀,簡單;但在需要一道對一道地比較兩個或更多個直方圖時,它又變得較復雜。參數方法是指被測量的生物學系統、細胞群體等等,能為一個數學模型所描述并表達成一個方程或方程組,用方程的變量可由被測的數據中提取有用的信息。例如對小鼠的精子DNA含量進行測量,結果得一尖銳的峰,如果可用正態分布描述全部數據,則參數是峰下的面積,平均值和方差。當然,zui終還要用zui小二乘方的方法來擬合數據。

非參數分析

 非參數分析常用于單參數直方圖的定量分析,圖是zui簡單的分析例子。

 此圖是人白細胞用吖啶橙染色后的直方圖,圖上有3個峰,從左到右依次是淋巴細胞、單核細胞和粒細胞。如果要計算各部分所占的百分比,只要計算3個峰下的面積即可。實際上,可在淋巴細胞的峰與單核細胞的峰之間的“谷”zui低處,人為的作一直線,垂直于橫坐標;在單核細胞與粒細胞間的“谷”的zui低處,再做一直線,3個峰各由直線為界,逐道計算峰下的細胞術并與總細胞相比,則可分別得出淋巴細胞、單核細胞、粒細胞在整個群體中所占百分數。

 在上述定量分析中,我們即沒有使用任何數學模型,也沒有引入任何變量,所以屬于非參數定量分析方法,也可稱為直觀分析法。

DNA直方圖的比較分析

 由于流式細胞術常測量DNA直方圖,因此,我們再討論一下另外一種定量分析方法。我們常會遇到比較兩個直方圖的場合。例如一個是對照組另一個是實驗組,或者一個是零時刻,另一個是某實驗時刻等等。圖所示是這種方法的一個應用實例。

   中國藏書卵巢細胞CHO分別用Hoechst  33258及Propidium  Iodide對DNA染色,然后經流式細胞計測量。為使測量結果更有統計學意義,對同一樣品應進行多次,例如10次的測量,然后取平均值,于是得到兩個直方圖。將兩圖歸一化,即將G1峰的位置調節到相同倒數上,然后將兩個圖畫在一起,即圖。其中實線是Hoechst  33258染色的,三角形是PI染色的。圖中每條曲線的總細胞也要歸一化到相同數值。

 從圖上我們不難得出,在G2M峰有較明顯的差異。33258染色的細胞,其G2M部分所占比例較大。如果將兩條曲線逐道相減,既得圖,在這個HO-PI圖中,G1峰對應的100道附近為正,可見33258染色的G1峰較PI染色的G1峰更為尖銳。S期部分PI略高一些,差異不大。實際大約相差13%。上述方法還可進一步發展,采用Kolmogorov-Smirnov檢驗或Gossett-T檢驗,有人曾用來識別人外周血的兩個淋巴類型。

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