導(dǎo) 讀
*學(xué)術(shù)期刊 《Cell》及其子刊公布了“癌癥和腫瘤基因圖譜”（TCGA）的“升級版”——泛癌癥圖譜（PanCancer Atlas）的研究結(jié)果，相關(guān)結(jié)果以二十幾篇高水平論文呈現(xiàn)，美國國家衛(wèi)生研究院資助的科學(xué)家團隊完成大規(guī)模癌癥基因組圖譜繪制，他們根據(jù)基因變異和表達的相似性，提出可以按照分子類型給癌癥進行“歸類”。研究人員認為，這將為癌癥診斷和治療提供新思路。
早在十幾年前就已開始的一項大規(guī)模研究工作 “PanCancer Atlas” 近日已全面完成，它為研究人員和臨床醫(yī)生提供了一種根據(jù)其基因組和分子特征全面了解癌癥的新方法。
PanCancer Atlas范圍非常廣，涵蓋了*學(xué)術(shù)期刊《Cell》及其子刊所發(fā)表的二十多篇科學(xué)論文。它代表癌癥基因組圖譜（TCGA）工作中的一個巨大里程碑。癌癥基因組圖譜（The Cancer Genome Atlas，TCGA）早已為*廣為知曉，這項計劃于2005年提出，旨在通過基因組學(xué)分析技術(shù)，將人類全部癌癥的基因組變異圖譜繪制出來，從而更好地了解癌癥發(fā)生和發(fā)展的機制。
該項目由國立衛(wèi)生研究院（NIH）的兩個研究機構(gòu)同時贊助，即國家癌癥研究所（NCI）和國家人類基因組研究所。
全美超過二十多個研究機構(gòu)的150多位研究人員參與了這項耗資3億美元的項目。“這個項目，是十多年開創(chuàng)性工作的結(jié)晶。”美國國立衛(wèi)生研究院院長弗朗西斯科林斯博士說。
從不同的角度看癌癥
癌癥是一種疾病，當(dāng)細胞由于其DNA的錯誤編碼開始失控時，就會出現(xiàn)這種疾病。傳統(tǒng)的癌癥分類方法是根據(jù)它在體內(nèi)的起始位置 - 如乳腺癌，前列腺癌或胃癌。
PanCancer Atlas的這項工作是2012年在加利福尼亞圣克魯斯舉行的一次會議上由Pan-Cancer Initiative發(fā)起的。
那時，科學(xué)家們已經(jīng)注意到一些關(guān)于癌癥的有趣特征，使他們對疾病分類的傳統(tǒng)方式產(chǎn)生質(zhì)疑。一個有趣的特征是，盡管癌細胞開始于身體的不同部位，但有一些癌癥在分子水平上是相似的。另一個有趣的特征是，在同一組織中開始的癌癥在分子水平上可能非常不同，具有不同的“基因組譜”。
對研究人員&臨床醫(yī)生的影響
這些早期的分子形態(tài)促使研究人員調(diào)查每種癌癥基因組中的變化——DNA的完整組合——可能會驅(qū)動某種疾病。
PanCancer Atlas是努力調(diào)查后的結(jié)果，將為改善各類癌癥的預(yù)防，檢測和治療鋪平道路。
正如Pan-Cancer Initiative協(xié)辦方Josh Stuart--加州大學(xué)圣克魯斯分校生物分子工程教授所說：“了解一種癌癥如何與另一種形式的疾病相關(guān)，可能具有真正的臨床意義。”他也認為，”在某些情況下，我們可以借鑒已知疾病的臨床實踐，并將其應(yīng)用于治療方案不明確的癌癥。“
從分子角度看，癌癥也為已被批準(zhǔn)用于其他具有癌癥分子特征的疾病的藥物開辟了道路。其中一個例子是在類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎中被激活的JAK / Stat分子途徑。研究人員發(fā)現(xiàn)，這個通路在一些新認定的腫瘤組中上調(diào)。
PanCancer Atlas論文
三個PanCancer Atlas論文集中的每一個都是由熱點或綜述和論文引入的。在門戶的登錄頁上有明確的鏈接和相關(guān)文章。
*篇綜述介紹了“cell-of-origin patterns”這一類別，概述了研究人員如何通過基因表達，染色體異常和DNA改變使“molecular clustering”形成腫瘤群。它表明這些發(fā)現(xiàn)將使不同類型的癌癥得到更具體的治療。
第二篇綜述介紹了“oncogenic processes” 種類，并認為這些發(fā)現(xiàn)將有助于研究人員確定他們應(yīng)該選擇哪些免疫療法和相應(yīng)治療方案的優(yōu)先順序。
除了給出一個廣泛的總結(jié)，該論文還描述了癌癥發(fā)展中三個關(guān)鍵過程的鑒定：①遺傳和獲得性突變; ②腫瘤基因組和表觀基因組如何影響基因和蛋白質(zhì)的表達; ③腫瘤細胞與免疫系統(tǒng)之間的相互作用。
第三篇綜述整理了“signaling pathways”的類型，并總結(jié)了調(diào)節(jié)細胞周期，細胞生長和細胞死亡的信號通路中基因組改變的發(fā)現(xiàn)。這篇論文強調(diào)了這些過程對于不同癌癥的相似性和差異性，并表明這些發(fā)現(xiàn)將有助于個性化用藥，還可以在聯(lián)合治療中開發(fā)新的治療方法。
“這個項目為癌癥研究人員提供了人類的途徑去了解腫瘤發(fā)生，發(fā)展以及從何而來等重要信息，從而優(yōu)化臨床試驗和未來的治療方案。”
——弗朗西斯科林斯博士
參考文獻
Catharine Paddock et.al Why does cancer arise? Landmark study provides unique insight. (2018)
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