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高壓輸液泵是液相色譜儀的核心。泵密封圈是最容易磨損的零件。密封圈損壞可能導致液體泄漏或壓力波動；止回閥的正常運行非常重要。如果失效，將直接影響流動穩定性。正常狀態下的高壓泵是液相色譜準確分析的基礎。高壓輸液泵由電機、凸輪組、柱塞桿和泵頭組成。
長期在高壓下運行會逐漸磨損泵頭的內部結構，尤其是在使用含鹽或未過濾的色譜時。泵的性能和使用在很大程度上與流動相有關。流動相在進入機器前必須經過過濾和脫氣。
所有溶劑在使用前必須經過0.45m(或0.22m)的過濾，以去除雜質顆粒。使用膜過濾時，要特別注意區分有機相(脂溶性)膜和水相(水溶性)膜。有機相濾膜一般用于過濾有機溶劑，過濾水溶液時流速低或過濾器不動。水相濾膜只能用于過濾水溶液，嚴禁使用有機溶劑，否則會溶解濾膜。對于混合流動相，可在混合前單獨過濾。如果混合后需要過濾，請選擇合適的過濾膜。選擇時，請參考濾膜的化學相容性表。
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