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亞胺培南會產生不良反應，對人體造成損傷，因此需使用血藥濃度分析儀定期監測血藥濃度。
1.局部反應 紅斑、局部疼痛和硬結、血栓性靜脈炎。
2.過敏反應/皮膚 皮疹、瘙癢、蕁麻疹、多形紅斑、史-約綜合征、血管性水腫、中毒性表皮壞死(罕見)、表皮脫落性皮炎(罕見)、念珠菌病、藥物熱。
3.胃腸道反應嘔吐、腹瀉、牙齒和/或舌色斑。已報道使用其他所有廣譜抗生素均可引起抗生素相關性腸炎。
4.血液 嗜酸性粒細胞增多癥、白細胞減少癥、中性粒細胞減少癥，包括粒細胞缺乏癥。血小板減少癥、血小板增多癥和血紅蛋白降低，以及凝血酶原時間延長均有報道。
5.肝功能 GOT及GPT、膽紅素和/或血清堿性磷酸酶升高；肝炎(罕見)。
6.腎功能 少尿/無尿、多尿、急性腎衰竭(罕見)；血尿素氮和肌酐升高。
7.神經系統/精神疾病 已有報道靜脈滴注本品可引起中樞神經系統的不良反應，如肌陣攣、精神障礙，包括幻覺、錯亂狀態或癲癇發作。感覺異常亦有報道。
8.特殊感覺 聽覺喪失、味覺異常。
9.心血管系統 低血壓、胸部不適、心悸。
10.呼吸系統 呼吸困難。
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