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信帆生物帶你全面了解DNA拓撲異構(gòu)酶I

時間:2017-4-12閱讀:1268
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信帆生物帶你全面了解DNA拓撲異構(gòu)酶I

 

DNA拓撲異構(gòu)酶為催化DNA拓撲學異構(gòu)體相互轉(zhuǎn)變的酶之總稱。催化DNA鏈斷開和結(jié)合的偶聯(lián)反應(yīng),為了分析體外反應(yīng)機制,用環(huán)狀DNA為底物。

 

在閉環(huán)狀雙鏈DNA的拓撲學轉(zhuǎn)變中,要暫時的將DNA的一個鏈或兩個鏈切斷,根據(jù)異構(gòu)體化的方式而分為二個型。

切斷一個鏈而改變拓撲結(jié)構(gòu)的稱為Ⅰ型拓撲異構(gòu)酶(top- oisomeraseⅠ),通過切斷二個鏈來進行的稱為Ⅱ型拓撲異構(gòu)酶(topoisomeraseⅡ)。

屬于Ⅰ型的拓撲異構(gòu)酶,有大腸桿菌的ω蛋白(ω-protein,由分子量11萬的單個多肽鏈所成)及各種真核細胞中存在的切斷-結(jié)合酶(nicking-closing enzyme,分子量約6萬5千—7萬的及分子量約10萬的)。

Ⅱ型拓撲異構(gòu)酶,有存在于細菌中的DNA促旋酶、噬菌體T4的拓撲異構(gòu)酶Ⅱ以及真核細胞中依賴ATP的拓撲異構(gòu)酶Ⅱ等。

另外,噬菌體λ的irt基因產(chǎn)物和噬菌體φX174的基因A的產(chǎn)物等也具有切斷—結(jié)合酶的活性,可認為是拓撲異構(gòu)酶之一種。

Ⅰ型拓撲異構(gòu)酶不需要ATP的能量而催化異構(gòu)體化,作為反應(yīng)的中間產(chǎn)物,在原核生物來說是游離型的5′-OH末端扣3′-磷酸末端與酶形成共價鍵,而真核生物是3′-OH末端5′-磷酸末端與酶形成共價鍵。

此酯鍵中所貯存的能量,可能在切斷端的再結(jié)合上起著作用。Ⅰ型拓撲異構(gòu)化酶催化的反應(yīng)有下列各種:使超螺旋DNA在每一切斷—結(jié)合反應(yīng)中,使L數(shù)(參見DNA拓撲學異構(gòu)體)發(fā)生一種變化,即松弛(relaxation)。

將互補的單鏈環(huán)狀DNA轉(zhuǎn)變成具有螺旋結(jié)構(gòu)的雙鏈環(huán)狀DNA,使單鏈DNA打結(jié)(topological knot)或解結(jié)。

另外在二個環(huán)狀雙鏈DNA一個分子的一個鏈切斷時,形成鏈環(huán)狀二聚體的分子(ca-tenane)。

 

信帆生物帶你全面了解DNA拓撲異構(gòu)酶I

 

在Ⅱ型拓撲異構(gòu)酶中,DNA促旋酶可單獨催化閉環(huán)狀DNA產(chǎn)生超螺旋,這是*的。其它二個型的酶,除可使超螺旋松弛也需要ATP的能量外,還可催化促旋酶的催化反應(yīng)。

真核細胞的拓撲異構(gòu)酶Ⅰ,參與核小體的形成,細菌的ω蛋白參與轉(zhuǎn)錄和某種轉(zhuǎn)位子的插入。促旋酶和T4拓撲異構(gòu)酶Ⅱ參與DNA的復制和轉(zhuǎn)錄過程。

DNA拓撲異構(gòu)酶在DNA解鏈時在將要打結(jié)或已打結(jié)處作切口。下游的DNA穿越切口并作一定程度的旋轉(zhuǎn),把結(jié)打開或解松,然后旋轉(zhuǎn)復位連結(jié)。

這樣解鏈就不因打結(jié)的阻絆而繼續(xù)下去。即使出現(xiàn)打結(jié)現(xiàn)象,雙鏈的局部打開,也會導致DNA超螺旋的其他部分過度擰轉(zhuǎn),形成正超螺旋。

拓撲酶通過切斷、旋轉(zhuǎn)和再連接的作用,實現(xiàn)DNA超螺旋的轉(zhuǎn)型,即把正超螺旋變成負超螺旋。

 I (DNA Topoisomerase I)催化4種反應(yīng):

1)催化負超螺旋DNA的松弛。


2) 在單鏈環(huán)狀DNA分子內(nèi)形成繩結(jié)(Knot t ing) 和解開繩結(jié)(Unknotting)。


3)催化具有互補堿基序列的環(huán)狀單鏈DNA形成雙鏈閉環(huán)狀DNA分子。


4)2個環(huán)狀雙鏈DNA分子之中的一個存在DNA鏈的切口時,發(fā)生兩個分子的連結(jié)反應(yīng)(Catenation)或者逆反應(yīng)(Decatenation)。


完整的DNA 拓撲異構(gòu)酶I(E. coli)全酶是一分子量97 kDa的蛋白。本DNA 拓撲異構(gòu)酶I是把topA基因(E. coli)在大腸桿菌中進行表達后,經(jīng)多次純化分離而得到的。

質(zhì)量保證 
本DNA 拓撲異構(gòu)酶I 經(jīng)多次柱純化,SDS-PAGE膠檢測僅可見清晰單一的目的條帶;PCR方法檢測無大腸桿菌DNA殘留,無核酸內(nèi)、外切酶污染。

使用建議 
DNA的結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)換和解析。 

 

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