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轉(zhuǎn)錄組研究原料解決方案,全在這里

2024-12-9  閱讀(195)

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全轉(zhuǎn)錄組研究


【全轉(zhuǎn)錄組測序—研究非編碼RNA與mRNA間的靶向調(diào)控以及相互作用關(guān)系】

全轉(zhuǎn)錄組高通量測序,采用去核糖體鏈特異性建庫方法和小片段富集篩選建庫方法,可實現(xiàn)編碼RNA和非編碼RNA的建庫、測序、信息分析及聯(lián)合分析、ceRNA等,從而快速全面準(zhǔn)確地獲得與特定生物學(xué)過程 (例如發(fā)育、疾病等)所有RNA轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)信息,通過數(shù)據(jù)分析將生物調(diào)控機制研究延伸到“ 網(wǎng)、多層面"結(jié)合的立體模式,有助于相對全面解讀生物學(xué)現(xiàn)象。

 

全轉(zhuǎn)錄組測序有兩種方式,一種是LncRNA-Seq + Small RNA,另一種是LncRNA-Seq+ Small RNA+ CircRNA,可以更加全面的獲取CircRNA的信息。

  • 兩種文庫的全轉(zhuǎn)錄組測序:LncRNA-Seq + Small RNA;

  • 三種文庫的全轉(zhuǎn)錄組測序:LncRNA-Seq+ Small RNA+ CircRNA。

 

 

全轉(zhuǎn)錄組技術(shù)路線

 

 

 

 

全轉(zhuǎn)錄組研究原料解決方案

 

動物類

植物類

細(xì)菌真菌類

樣本類型

動物組織/細(xì)胞

細(xì)胞

全血

植物組織

真菌組織

培養(yǎng)的細(xì)菌和真菌

RNA提取

磁珠法:18605/18607/18606
柱式法:19221/19211
Trizol法:10606/19202

磁珠法:18600/18604
柱式法:19231

柱式法:19241
Trizol法:19201

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

柱式法:19301(真菌需要加溶壁酶10403)

miRNA提取

柱式法:19331

柱式法:19331

柱式法:19332

柱式法:19331

miRNA文庫構(gòu)建

敬請期待

rRNA去除

RNaseH酶法去除:12257
3 min快速去除:12258(人源去除)
磁珠法去除:12266(哺乳動物通用型)/12267鳥類通用型/12268家雞/12269斑馬魚/12270果蠅 /12275牡蠣/12278渦蟲/12285蜜蜂/12286橫紋金蛛/12289蜱蟲/12290白紋伊蚊/12287線蟲

RNaseH酶法去除:12257
3 min快速去除:12258(人去除,適合病原)

RNaseH酶法去除,包含去除珠蛋白:12257+12806

RNaseH酶法去除珠蛋白:13572
3 min快速去除:12258+12260

RNaseH酶法去除:12254
磁珠法去除:12262被子植物

磁珠法去除:12271真菌通用型

磁珠法去除:12264細(xì)菌通用型/12265原核生物通用型

文庫構(gòu)建

非預(yù)混RNA建庫試劑盒:12308雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI)
預(yù)混版RNA建庫試劑盒:12310雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI)/12340(不含放線菌素D,dUTP)/12341(不含放線菌素D,dTTP)

 

LncRNA研究

長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA, LncRNA)是近年來引起廣泛關(guān)注的一種具有的調(diào)控功能的非編碼RNA。LncRNA的長度在200nt以上,不編碼蛋白,物種間保守性較差,有的序列結(jié)構(gòu)與mRNA相似(含有polyA尾,存在可變剪切),有的則無這些特征。目前的研究對LncRNA的產(chǎn)生和功能機制尚未有明確的認(rèn)識,但已有多種具有重要生物功能(如癌癥發(fā)生、X染色體沉默以及與其他調(diào)控因子作用構(gòu)成復(fù)雜調(diào)控網(wǎng)絡(luò)等)的LncRNA被發(fā)現(xiàn)。

 

 

LncRNA測序技術(shù)路線

 

 

 

LncRNA測序原料解決方案

 

動物類

植物類

細(xì)菌真菌類

樣本類型

動物組織/細(xì)胞

細(xì)胞

全血

植物組織

真菌組織

培養(yǎng)的細(xì)菌和真菌

RNA提取

磁珠法:18605/18607/18606
柱式法:19221/19211
Trizol法:10606/19202

磁珠法:18600/18604
柱式法:19231

柱式法:19241
Trizol法:19201

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

柱式法:19301(真菌需要加溶壁酶10403)

rRNA去除

RNaseH酶法去除:12257
3 min快速去除:12258(人源去除)
磁珠法去除:12266(哺乳動物通用型)/12267鳥類通用型/12268家雞/12269斑馬魚/12270果蠅 /12275牡蠣/12278渦蟲/12285蜜蜂/12286橫紋金蛛/12289蜱蟲/12290白紋伊蚊/12287線蟲

RNaseH酶法去除:12257
3 min快速去除:12258(人去除,適合病原)

RNaseH酶法去除,包含去除珠蛋白:12257+12806

RNaseH酶法去除珠蛋白:13572
3 min快速去除:12258+12260

RNaseH酶法去除:12254
磁珠法去除:12262被子植物

磁珠法去除:12271真菌通用型

磁珠法去除:12264細(xì)菌通用型/12265原核生物通用型

文庫構(gòu)建

非預(yù)混RNA建庫試劑盒:12308雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI)
預(yù)混版RNA建庫試劑盒:12310雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI)/12340(不含放線菌素D,dUTP)

 

真核轉(zhuǎn)錄組研究

真核轉(zhuǎn)錄組研究,通過RNA-seq技術(shù)獲得特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的mRNA的總和,隨后對下機的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行拼接組裝,對基因的表達(dá)量進(jìn)行統(tǒng)計,并進(jìn)行差異分析和功能富集分析。既能獲得該物種絕大部分基因信息又能從整體水平研究基因表達(dá)差異及功能通路變化,揭示特定生物學(xué)過程的分子機制。

 

 

真核轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)路線

 

 

 

真核轉(zhuǎn)錄組測序原料解決方案

 

動物類

植物類

真菌類

樣本類型

動物組織/細(xì)胞

細(xì)胞

全血

植物組織

真菌組織

培養(yǎng)的真菌

RNA提取

磁珠法:18605/18607/18606
柱式法:19221/19211
Trizol法:10606/19202

磁珠法:18600/18604
柱式法:19231

柱式法:19241
Trizol法:19201

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

柱式法:19301(加溶壁酶10403)

mRNA捕獲

12629 mRNA Isolation Master Kit

文庫構(gòu)建

非預(yù)混RNA建庫試劑盒:12308雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI)

非預(yù)混RNA建庫試劑盒-含mRNA捕獲:12309雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI)
預(yù)混版RNA建庫試劑盒:12310雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI)/12340(不含放線菌素D,dUTP)

 

circRNA研究

【circRNA測序—研究circRNA的差異表達(dá)如何影響生物學(xué)過程】

環(huán)狀RNA(circular RNA, circRNA)是一類特殊的非編碼RNA分析,測序采用測序平臺進(jìn)行測序,針對有參考基因組樣本開展準(zhǔn)確的circRNA鑒定以及來源基因的分析, 環(huán)狀RNA測序在醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)研究領(lǐng)域應(yīng)用越來越廣泛。基于高通量測序,依據(jù)主流數(shù)據(jù)庫和circRNA鑒定軟件,分析項目物種的circRNA信息,深入挖掘circRNA在轉(zhuǎn)錄調(diào)控中所發(fā)揮的重要功能。

 

 

circRNA測序技術(shù)路線

 

 

 

circRNA研究原料解決方案

 

動物類

植物類

細(xì)菌真菌類

樣本類型

動物組織/細(xì)胞

細(xì)胞

全血

植物組織

真菌組織

培養(yǎng)的細(xì)菌和真菌

RNA提取

磁珠法:18605/18607/18606
柱式法:19221/19211
Trizol法:10606/19202

磁珠法:18600/18604
柱式法:19231

柱式法:19241
Trizol法:19201

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537
柱式法:19291ES/19292ES

柱式法:19301(真菌需要加溶壁酶10403)

rRNA去除

RNaseH酶法去除:12257
3 min快速去除:12258(人源去除)
磁珠法去除:12266(哺乳動物通用型)/12267鳥類通用型/12268家雞/12269斑馬魚/12270果蠅 /12275牡蠣/12278渦蟲/12285蜜蜂/12286橫紋金蛛/12289蜱蟲/12290白紋伊蚊/12287線蟲

RNaseH酶法去除:12257
3 min快速去除:12258(人去除,適合病原)

RNaseH酶法去除,包含去除珠蛋白:12257+12806

RNaseH酶法去除珠蛋白:13572
3 min快速去除:12258+12260

RNaseH酶法去除:12254
磁珠法去除:12262被子植物

磁珠法去除:12271真菌通用型

磁珠法去除:12264細(xì)菌通用型/12265原核生物通用型

線性RNA消化

14606 RNase R 去除線性RNA分子

文庫構(gòu)建

非預(yù)混RNA建庫試劑盒:12308雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI)
預(yù)混版RNA建庫試劑盒:12310雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI)/12340(不含放線菌素D,dUTP)

 

宏轉(zhuǎn)錄組

【宏轉(zhuǎn)錄組—捕捉微生態(tài)微環(huán)境活性微生物動態(tài)變化】

宏轉(zhuǎn)錄組測序:(Metatranscriptome Sequencing/ Metatranscriptomics)從整體水平研究特定環(huán)境中所有群體基因組轉(zhuǎn)錄情況和調(diào)控規(guī)律,以微生態(tài)微環(huán)境中全部RNA為研究對象, 結(jié)合高通量測序從轉(zhuǎn)錄水平研究復(fù)雜微生物群落變化,挖掘發(fā)揮功能的活性基因。

 

 

宏轉(zhuǎn)錄組研究原料解決方案

 

樣本類型

培養(yǎng)的細(xì)菌和真菌

臨床樣本

RNA提取

柱式法:19301(真菌需要加溶壁酶10403)

柱式法:19321(病毒DNA/RNA提取)

磁珠法:18521(病毒DNA/RNA提取)

18306(病原DNA/RNA提取)

rRNA去除

3 min快速去除:12258(人源去除)

文庫構(gòu)建

方案1. Total RNA建庫: 12308ES雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI)

方案2. cDNA酶切建庫:13488ES cDNA合成模塊+12316ES 快速酶切法建庫試劑盒

 

產(chǎn)品推薦

產(chǎn)品名稱

貨號

規(guī)格

Hieff NGS ® EvoMax RNA Library Prep Kit(dUTP)
鏈特異性預(yù)混版total RNA建庫試劑盒(不含放線菌素D)

12340ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® EvoMax RNA Library Prep Kit(dNTP) 預(yù)裝板RNA建庫試劑盒(不含放線菌素D)

12341ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit 雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI)

12308ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit(Premixed version)
預(yù)混版total RNA建庫試劑盒(含放線菌素D)

12310ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit V2
 mRNA純化試劑盒V2

12629ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)
人/小鼠/大鼠核糖體RNA去除試劑盒

12257ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit(Plant)
植物核糖體RNA去除試劑盒

12254ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® One-Step rRNA Removal Kit(Human,100-1,000 ng) 一步快速去除核糖體RNA試劑盒(人)

12258ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Bacteria(G- and G+)) with purification beads
細(xì)菌核糖體RNA去除試劑盒

12264ES24/96

24 T/ 96 T



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