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CRISPR技術自2012年問世至今,憑借其的性能,迅速在基因編輯領域嶄露頭角,成為了基因編輯工具。這一技術的誕生,為基因功能研究、藥物靶點篩選、遺傳疾病治療、癌癥研究以及作物育種等多個領域帶來了突破性的進展。因其顯著的成果,科學家Emmanuelle Charpentier和Jennifer A. Doudna榮獲了2020年諾貝爾化學獎。
圖1. 2020年諾貝爾化學獎得主[1]
CRISPR/Cas系統的核心依賴于兩個主要組件:一是具有核酸切割能力的Cas蛋白;二是特異性指導Cas蛋白精確剪切的向導RNA(gRNA)。因此,在基因編輯過程中,除了選擇合適的高效Cas蛋白外,精心構建高效且具有針對性的sgRNA同樣至關重要。gRNA由一個tracrRNA和至少一個crRNA組合構成,Emmanuelle Charpentier和Jennifer A. Doudna通過將tracrRNA和crRNA融合成一條單鏈——單鏈向導RNA(sgRNA),極大地簡化了sgRNA的生成和應用步驟。通常所說的sgRNA設計實際上是指對其中的crRNA組成部分進行精確設計,以便挑選出適合的sgRNA。
圖2. sgRNA示意圖(以Cas9為例)
sgRNA的合成方式
sgRNA的合成方法主要分為體外轉錄(IVT)和化學合成兩種,其中,由于IVT方法具備操作靈活、成本效益高以及產出量大等優勢,在實驗室環境中被廣泛采用。
經過精心的設計與開發,翌圣生物推出了專門針對Cas9蛋白的sgRNA體外轉錄合成試劑盒——Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit(11355ES)。該試劑盒的應用極為簡便,用戶只需設計一條特定的上游引物,并結合試劑盒提供的其他試劑,即可在短短4h內合成20-100 μg高品質的sgRNA。所產生的sgRNA具備高產量、高純度和高活性等優勢,在基因編輯過程中能顯著提升編輯效率,并大幅降低脫靶現象的發生幾率,確保基因編輯工作以高效率和高準確性進行。
翌圣sgRNA合成試劑盒性能展示
高合成產量
單管反應4h,sgRNA產量可達20-100 μg
sgRNA的濃度關系到CRISPR/Cas9系統的編輯效果成敗,只有加入高濃度的sgRNA方能對基因的編輯起較好效果。翌圣的Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit可在單管反應4h內獲得20-100 μg的sgRNA,足以滿足基因編輯的需要。
圖3. 不同時間的sgRNA的合成量
適用范圍廣
不同種類的sgRNA均可獲得高產量
一個優質的sgRNA Synthesis Kit不僅應具備高產量sgRNA的合成能力,還應兼容各種類型的sgRNA合成,以滿足不同基因編輯的需求,從而拓寬產品的應用范圍。使用翌圣生物的Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit同時合成10種不同序列的sgRNA,實驗結果表明,該試劑盒能夠高效合成不同序列的sgRNA,在使用過程中無需考慮序列差異的影響。
圖4. 不同序列的sgRNA的合成產量
高純度
合成的sgRNA條帶單一
除了sgRNA的產量,合成的sgRNA的純度也是影響CRISPR/Cas9系統的編輯的效果的關鍵因素之一。如果合成的sgRNA的純度差,易出現脫靶效應。翌圣Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit合成的sgRNA經過安捷倫2100測定,其條帶明顯且無雜帶,說明sgRNA純度高。
圖5. 合成的sgRNA的純度(安捷倫2100測定)
高活性
合成的sgRNA可有效引導Cas9切割靶標DNA
使用翌圣Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit合成的sgRNA與Cas9組合用于體外切割靶DNA,經瓊脂糖凝膠電泳檢測發現所合成的sgRNA可以有效引導Cas9在特定位點切割并產生特定大小的DNA片段。
圖6. sgRNA的剪切效率效果圖
翌圣生物一直深耕基因編輯領域,并推出了一系列高品質的原料,旨在為基因編輯技術的發展和進步提供支持。除了Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit外,翌圣生物可提供基因編輯相關蛋白,如Cas9、Cas12a和Cas12b等相關產品。
基因編輯相關產品
產品分類 | 產品名稱 | 產品貨號 |
sgRNA合成 | Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit | 11355ES |
Cas蛋白 | Cas9 Nuclease | 14701ES |
ArCas12a Nuclease (10 μM) | 14702ES | |
AapCas12b Nuclease (10 μM) | 14808ES | |
sgRNA純化 | Hieff NGS® RNA Cleaner | 12602ES |