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干貨分享 | 一套搞定,小翌助您跑出的電泳圖!

2024-1-10  閱讀(449)

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核酸電泳是進行核酸研究的重要手段,是分離、鑒定和純化核酸的主要方法。核酸電泳一般有瓊脂糖凝膠電泳和聚丙烯酰胺凝膠電泳。瓊脂糖凝膠電泳是以瓊脂糖作為支持介質的一種電泳方法,常用于DNA切膠回收,DNA分離和用于佐證DNA是否重組、質粒是否切開等等,因其分離范圍較廣,在實驗室中應用廣泛。

 


 

操作流程

 

圖1.核酸電泳操作流程

 

01

電泳緩沖液制備

 
 

電泳緩沖液是核酸凝膠電泳系統的一個重要組成,主要作用是維持合適的pH,使溶液兩極的pH保持基本不變。且具有一定的導電性,利于核酸分子從負極遷移到正極。其成分及其離子強度影響物質的電泳遷移率,內含的EDTA可螯合Mg2+等二價陽離子,防止電泳時激活DNA酶及Mg2+與核酸生成沉淀,保護樣本的理化性質不變。

 

核酸電泳緩沖液分為TAE緩沖液、TEB緩沖液、TPE緩沖液,因為雙鏈線狀DNA在TAE的遷移率較其他兩種緩沖液更快,因此實驗室多使用TAE電泳緩沖液。

 

50×TAE Buffer配制單如下表所示:(使用時需稀釋50倍)

試劑

稱量值

方法

Tris(氨基丁三醇)

242 g

置于1 L燒杯中,加入約600 mL去離子水,充分攪拌均勻;

Na2EDTA·2H2O

37.2 g

CH3COOH(冰乙酸)

57.1 mL

充分溶解后,用NaOH調pH至8.3,加去離子水定容至1 L。

 

02

配制瓊脂糖凝膠

 
 

瓊脂糖是純化的線性半乳聚糖親水膠體,提取自瓊脂或者含瓊脂的海藻。瓊脂糖的基本參數包括:硫酸鹽含量、凝膠強度、膠凝點、電內滲(EEO)等。合適的瓊脂糖是核酸電泳跑出好膠的重要前提,翌圣高質量瓊脂糖(Cat#10208ES),膠孔清晰、膠體不易斷,具備純度高(硫酸鹽含量低)、凝膠強度大、膠凝點相對高(常溫條件下凝固快)、電內滲低等特點,是實驗室DNA/RNA凝膠電泳的  。

 

 

產品優勢

嚴格控制瓊脂糖參數,保證凝膠質量

 

電滲值低(EEO≤0.13),條帶分離效果好,分得開、跑得快;

圖2.不同濃度凝膠電泳圖

 

注:0.75%瓊脂糖凝膠上樣:1kb ladder,1%瓊脂糖凝膠上樣:100 bp ladder、1kb ladder、2000 DNA Marker、5000 DNA Marker,2%瓊脂糖凝膠上樣:100 bp ladder、2000 DNA Marker、5000 DNA Marker;上樣量:Marker 原液 2 μl 稀釋 5 倍后上樣 10 μl;0.75%、1%、2%瓊脂糖凝膠電泳程序分別為:115V,45min;130V,40 min;130V,50 min。

 

瓊脂糖凝膠電泳必然離不開核酸染料的加持,核酸染料一般是芳香環化合物,這些化合物能夠與DNA中的核苷酸發生靜電作用,從而將核酸染料吸附到DNA分子表面。分子中含有的環結構可以吸收紫外線或藍光,并發出熒光。翌圣核酸染料YeaRed/YeaGreen是油性大分子產品,不能穿透細胞膜進入細胞內,不易揮發升華,人體不會吸入,經過艾姆斯氏和相關測試表明這兩種染料無明顯誘變性,是集高靈敏、低毒性和超穩定于一身 的熒光核酸凝膠染色試劑。

 

 

瓊脂糖凝膠配制對照表

 

03

Marker選擇

 
 

DNA Marker是分子量不同的DNA片段的組合,主要用途為DNA分子凝膠電泳時,與樣品共同加入凝膠中進行電泳分離,通過樣品條帶與DNA Marker對應條帶大小及亮度的對比,可以粗略估算樣品DNA分子量的大小以及在溶液中的濃度。


目前翌圣生物DNA Marker分子量大小范圍覆蓋了從50 bp到15 kb的DNA片段,符合絕大多數實驗需求。Marker上樣量通常為5-10 μL,如果大分子條帶彎曲、拖尾且分不開,可以將Marker原液2 µL稀釋5倍加10 µL,條帶清晰不拖尾。

 

 

小翌助您跑出的電泳圖,每天都出好數據。

 

相關產品如下表所示,歡迎選購。


產品定位

產品名稱

產品貨號

規格

高質量瓊脂糖

Agarose瓊脂糖

10208ES60/76

100 g/500 g

Low Melting Point Agarose 低熔點瓊脂糖

10214ES25/60

25 g/100 g

3:1 Agarose 3:1瓊脂糖

10220ES25/60

25 g/100 g

High Sieving Agarose 高分辨率瓊脂糖(PCR級)

10221ES08/25

5 g/25 g

Agarose Tablets 瓊脂糖(片劑,0.5 g/片)

10226ES70

1盒(200片)

核酸染料

YeaRed Nucleic Acid Gel Stain(10,000× in Water) YeaRed核酸染料(10,000× 水溶液)

10202ES76

500 μL

YeaGreen Nucleic Acid Gel Stain (10,000×in Water)

10204ES76

500 μL

DNA Marker

GoldBand DL2,000 DNA Marker

10501ES60

100 T

GoldBand DL600 DNA Marker

10502ES60

100 T

GoldBand DL5,000 DNA Marker

10504ES60

100 T

GoldBand 100 bp DNA ladder

10507ES60

100 T


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