分子蒸餾可得到純凈安全的產物，且操作工藝簡單，設備少。分子蒸餾技術能分離常規蒸餾不易分離的物質，分子蒸餾裝置必須保證體系壓力達到的高真空度，對材料密封要求較高，且蒸發面和冷凝面之間的距離要適中，設備加工難度大，造價高。
分子蒸餾產品的耗能小，由于分子蒸餾整個分離過熱損失少，由于分子蒸餾裝置*的結構形式，其內部的壓強極低且內部阻力遠比常規蒸餾小,因而可大大節省能耗。
對于高沸點、熱敏及易氧化物料的分離,分子蒸餾提供了*分離方法。因為分子蒸餾在遠低于物料沸點的溫度下操作,而且物料停留時間短。
分子蒸餾的蒸餾液膜薄，整個產品的傳熱效率高，其物料的受熱時間短，受加熱的液面和加冷凝面之間的距離小于輕分子的平均自由程，所以由液面逸出的輕分子幾乎未經碰撞就達到冷凝面。
作為主要用于傳質過程的塔設備，首先必須使氣液兩相能充分接觸，以獲得較高的傳質效率，除了應滿足工藝條件，還應滿足如下基本要求：
1.生產能力要大。即單位塔截面上單位時間內物料的處理量要大。在較大的氣液流速下，仍不知發生大量的霧沫夾帶、攔液或液泛等破壞正常操作的現象。
2.分離效率高。即氣、液相能充分接觸且分離效果好。
3.操作彈性大。即有較強的適應性和寬的操作范圍。能適應不同性質的物料且在負荷波動時能維持操作穩定，仍有較高的分離效率。
4.壓降小。即流體通過時阻力小，這樣可大大節約生產的動力消耗，降低成本，在減壓塔中若壓降過大系統將難以維持必要的真空度
5.結構簡單、耗材少，易于制造及安裝，這樣可減少投資，降低成本。
6.耐腐蝕不易堵塞，便于操作、調節及檢修。
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