“十三五”時期，各地要根據“十二五”大氣污染防治所做的工作及存在的問題，科學編制“十三五”大氣污染防治規劃，有針對性提出大氣污染防治的目標、措施，體現以目標為導向，以問題為導向，切實改善空氣質量。
首先，各地在編制“十三五”大氣污染防治規劃時，要體現綠色發展和生態文明的理念。在“十三五”大氣污染防治規劃的指導思想方面，要明確提出貫徹落實黨的十八大及十八屆三中、四中、五中全會精神，牢固樹立創新、協調、綠色、開放、共享的發展理念，堅持節約資源和保護環境基本國策，高舉綠色發展大旗，以傳統工業綠色化改造為重點，以綠色科技創新為支撐，構建綠色工業、綠色農業，推動綠色產品、綠色消費全面發展，建立健全綠色發展長效機制，走、清潔、低碳、循環的綠色發展道路，推動工業文明、農業文明與生態文明和諧共融，實現人與自然和諧相處。
其次，“十三五”大氣污染防治規劃要體現科學性和可操作性。
一是在“十三五”大氣污染防治目標設定方面，要科學合理。省級環保部門編制的“十三五”大氣污染防治規劃削減指標時，應根據總削減量，不搞平均主義，不能僅以各地2015年實際完成的數字為基數進行削減，應立足于全省“一盤棋”的思想，統一進行削減，或分區域削減。
二是要開展大氣污染源調查，進行源解析。只有找準污染源，才能系統地分析出誰是造成當地大氣污染的主要污染源，到底是工業污染源，還是移動源汽車，或者是面源污染，找準了誰是主要污染，才能對癥下藥。而目前的現狀是，除了直轄市和省會城市，地市級的基本上是一本糊涂賬，大氣污染源急需搞清楚。
三是加強地方立法。目前，市一級的人大常委會有了地方立法權。各地可以根據當地實際，有針對性地加強地方立法，解決當地造成大氣污染的突出環境問題。
四是“十三五”大氣污染防治規劃要體現*主導、部門配合。“十三五”大氣污染防治規劃要體現地方各級*對當地的環境質量負責，對本行政區域內的大氣環境質量負總責，是統領責任。要根據國家的總體部署及控制目標，確定“十三五”時期工作重點任務和年度控制指標，完善政策措施；要不斷加大監管力度，確保任務明確、項目清晰、資金保障。
再次，“十三五”大氣污染防治規劃應體現區域聯防聯控。多年的實踐證明，造成一個地方大氣污染的原因，除了本地污染源的因素，區域輸入性污染的影響不可忽視。目前，我國已建立京津冀、長三角區域大氣污染防治協作機制，由區域內省級人民*和國務院有關部門參加，協調解決區域突出環境問題，組織實施環評會商、聯合執法、信息共享、預警應急等大氣污染防治措施，通報區域大氣污染防治工作進展，研究確定階段性工作要求、工作重點和主要任務。