水分測定儀在使用過程中除了要嚴格按照規程操作外，還應該注意以下問題：
■系統全密閉問題。試劑液路部分連接一定要緊固，從試劑瓶到計量泵再到反應池，否則發生試劑泄漏將直接影響測試結果。其不密閉的另一個問題是測試時由于試劑在試驗中吸收空氣水分，會導致滴定終點延遲。
■取樣的準確問題。在標定試劑時需要取用10mg水，盡量使用10ul取樣器，這樣不但準確、速度快，還能夠防止水滴粘附。同樣地，取用甲醇試劑、乙酯也有類似的問題，取放完畢后應注意盡量縮短反應池打開的時間。
■磁性攪拌速度調整。在反應池中，因為滴定試劑加入時在局部，與電極不在一處，因此攪拌速度*以快到不形成湍流為止，這樣可以快達到終點。
■滴定速度設定應先快后慢。滴定時先快速以盡量縮短試驗時間，而在接近終點時應變慢，這樣可提高計量準確度。
■當日試驗完畢后，一定要排空系統中的試劑，然后用甲醇清洗干凈，千萬不能用水清洗系統，因為其不容易揮發，將造成下次試驗時試劑標定不實。
■水分測定儀應該遠離強磁場，避免工作時顯示跳動，出現不正常現象。手動的水分測定儀，因為必須使用玻璃自動滴定管計量試劑和甲醇溶劑，而玻璃滴定管本身因為平衡壓力的關系，又必須與外界接通。
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