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從預制的入GTll文庫中制備cDNA插入片段

2013-3-12  閱讀(1634)

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[方法]
A.PCR擴增cDNA插入片段
1.在冰浴中將以下成分加到0.2m1微量離心管中(執行10步反應)
● 水,36.5ul
● 10×Pfu緩沖液,5.0ul
● 10mmol/L dNTP, 1.5ul
● λGTll正向引物 (10umol/L),2.5ul
● λGTll反向引物(10umol/L),2.5ul
● 已制備好的Sfi-NotIλGTll cDNA文庫,1.Oul
● PfuDNA聚合酶(2.5U/ul),1.0ul
2.混合反應物并用50ul的礦物油覆蓋。
3.在95℃下使模板變性2分鐘,按如下操作執行25次循環: (a)95℃變性1分鐘; (b)50℃退火1分鐘;(c)72℃延伸3分鐘(zui后一輪的延伸時間增加到7分鐘)。
B.純化并用限制性內切酶消化擴增的cDNA1.純化在A部分中用QIAquick PCR擴增儀器得到了PCR產物,每兩個PCR反應用一個旋轉柱并在30ul的水中提取純化的PCR產物。
2.收集提取的PCR產物,如下所示建立限制性消化:
● 水,25ul
● 純化的PCR產物,150ul
● 10X限制性內切酶緩沖液,20ul
● 限制性內切酶(10U/ul),5ul
3.在適當的溫度消化2小時。
C.對擴增和消化的cDNA按大小進行分餾并重新獲得cDNA1.在0.8%(w/v)瓊脂糖/TAE凝膠(允許電壓為1~5V/cm)上純化限制酶的消化產物。
2.用無菌刀小心地切除靶區域(500~3000bp),將凝膠片轉移到15ml的聚丙烯管中。注意:增加了跑膠時間會導致靶區域的擴大。
3.用Geneclean或WizardPCRDNA預純化系統來純化瓊脂糖凝膠分離的片段,在50ul的水中重新得到擴增的cDNA。
4.用DNA濃度測量試劑盒來估計DNA的濃度。

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