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上海起發(fā)實驗試劑有限公司

Parse Biosciences:告別微流控,用‘固定樣本’重新定義單細胞測序

時間:2025-4-14閱讀:96
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Parse Biosciences:告別微流控,用‘固定樣本’重新定義單細胞測序

Parse Biosciences是一家專注于單細胞測序技術研發(fā)與應用的生物科技公司,致力于通過創(chuàng)新技術降低科研門檻并推動生命科學研究的邊界。公司核心優(yōu)勢在于的組合條形碼(combinatorial barcoding)技術,該技術無需依賴復雜儀器即可實現(xiàn)大規(guī)模單細胞實驗,最高可同時處理500萬細胞及384個樣本的實驗需求(如旗艦產品Evercode WT Penta)。這一突破使研究人員能夠以傳統(tǒng)液滴法無法企及的通量和成本效益開展深度研究。

Parse的產品矩陣覆蓋從基礎轉錄組到免疫分析的全場景需求。其全轉錄組系列(WT Mini/Mega/Penta)提供靈活的通量選擇,結合專有的樣本固定技術,允許用戶根據(jù)實驗節(jié)奏安排樣本處理,減少實驗誤差。免疫分析產品線(TCR/BCR)則聚焦于免疫系統(tǒng)的復雜性,通過單細胞分辨率解析T/B細胞受體與基因表達的關聯(lián),助力腫瘤免疫治療等領域的突破。此外,CRISPR Detect和Gene Select模塊分別針對基因編輯篩選和靶向測序優(yōu)化,擴展了技術的應用維度。

技術優(yōu)勢體現(xiàn)在三大層面:其一,高通量低偏差,組合條形碼有效規(guī)避液滴法中的擴增偏差與背景噪音,顯著提升低豐度基因檢出率;其二,全流程自動化,從樣本固定到數(shù)據(jù)分析的端到端解決方案(含Trailmaker生物信息學平臺)降低操作門檻;其三,靈活適配性,兼容新鮮/凍存樣本及多種組織類型,滿足基礎研究與臨床轉化的雙重需求。第三方驗證數(shù)據(jù)顯示,其在小鼠腦組織、PBMC等樣本中展現(xiàn)出優(yōu)于主流液滴技術的細胞捕獲效率與基因檢測深度。

作為一家技術驅動型公司,Parse已建立全球合作伙伴網絡,服務超2000家實驗室,客戶涵蓋頂尖高校、藥企及CRO機構。其學術合作成果頻現(xiàn)于《Nature》《Cell》子刊,近期研究包括免疫系統(tǒng)發(fā)育圖譜繪制與癌癥微環(huán)境動態(tài)解析。公司持續(xù)推動技術迭代,計劃將單細胞多組學整合至現(xiàn)有平臺,并拓展空間轉錄組應用場景。


核心優(yōu)勢

1.革命性Evercode技術

無需微流控設備:突破傳統(tǒng)液滴法限制,支持標準實驗室操作,大幅降低硬件依賴。

超高通量:單次實驗可分析1萬至500萬個細胞,滿足大規(guī)模研究需求(如2025年推出的Evercode WT Penta試劑盒)。

樣本靈活性:支持細胞/核固定技術,樣本可穩(wěn)定保存6個月,便于時間序列研究或跨實驗整合。

2.數(shù)據(jù)質量與靈敏度

通過組合條碼系統(tǒng)(Evercode Barcoding)實現(xiàn)高特異性,檢測靈敏度優(yōu)于傳統(tǒng)方法,減少測序深度需求。

集成數(shù)據(jù)分析工具Trailmaker™,提供從原始數(shù)據(jù)到可視化報告的全流程支持,無需編程基礎。

3.多組學擴展能力

產品線涵蓋轉錄組、TCR/BCR免疫組庫、CRISPR篩選及染色質可及性分析,支持跨維度研究。


主要產品、技術介紹:

1.EVERCODE™ WT MINI

Parse Biosciences:告別微流控,用‘固定樣本’重新定義單細胞測序

Evercode™ WT Mini 的尺寸非常適合開始探索單細胞轉錄組學,并體驗 Parse 能帶來的高質量結果。在擴展到 Evercode™ WT 或 Evercode™ WT Mega 之前,先生成概念驗證結果,深入研究你的生物學。

Evercode™ 分池組合條形碼是一種簡單、無需儀器的單細胞測序解決方案。這種易于采用的方法為任何實驗室?guī)砹烁叩撵`敏度、可擴展性和靈活性。


2.EVERCODE™ WT

Parse Biosciences:告別微流控,用‘固定樣本’重新定義單細胞測序

Parse Biosciences Evercode™ WT 組合條形碼技術與基于液滴的10x Genomics™ Chromium™ Next GEM單細胞3’試劑盒v3.1(帶有小鼠大腦核)進行了比較。這種異質樣本類型一直是細胞圖譜項目的重點,也是個別研究人員的關注點。

收集了兩個E18期的C57/BI6胚胎樣本,沿著矢狀方向切分為兩半,并由第三方組織供應商快速冷凍。每只大腦的一半被運送到10x Genomics™認證的服務提供商,他們使用Chromium™ Nuclei Isolation Kit分離細胞核,并使用Chromium™ Next GEM Single Cell 3’ GEM Library & Gel Bead Kit v3.1建立測序文庫。每只大腦的另一半由Parse Biosciences處理,使用dounce勻漿器分離細胞核,用Evercode™ Nuclei Fixation v2固定,并用Evercode™ WT v2進行文庫制備。每種技術的測序文庫由第三方進行測序。測序數(shù)據(jù)使用各制造商的數(shù)據(jù)分析管道進行分析。


3.EVERCODE™ BCR

Parse Biosciences:告別微流控,用‘固定樣本’重新定義單細胞測序

探索具有EverCode™BCR的各種自適應免疫應用 - 不含儀器的固定樣品BCR分析解決方案,可檢測全長,本機的重型和輕型鏈序列,以全面地表征BCR庫。

捕獲全長B細胞受體序列與基因表達——以龐大的規(guī)模實現(xiàn)同步解析

通過靈敏檢測B細胞受體,揭示免疫組庫的全部復雜性。在同一細胞中測定全轉錄組基因表達,并獲取配對的重鏈/輕鏈全長序列及其同種型信息。


目標客戶群體

科研機構:高校、醫(yī)學研究中心,需開展癌癥、神經退行性疾病等單細胞機制研究。

制藥與生物技術公司:用于靶點發(fā)現(xiàn)、藥物篩選及臨床試驗生物標志物開發(fā)。

臨床診斷實驗室:推動個性化醫(yī)療,如腫瘤微環(huán)境分析、免疫治療響應預測。


常見問題與解答

Q1:Evercode技術是否兼容現(xiàn)有測序平臺?

A:是的!Parse試劑盒生成的標準FASTQ文件可兼容Illumina、NovaSeq等主流平臺,且數(shù)據(jù)分析工具支持與10x Genomics、BD Rhapsody數(shù)據(jù)混合分析。

Q2:樣本處理需要特殊設備嗎?

A:無需微流控儀器。Evercode固定技術僅需常規(guī)移液設備,樣本可常溫運輸。

Q3:如何解決低起始量樣本的挑戰(zhàn)?

A:推薦使用Evercode Low Input Fixation Kit,支持100個細胞起始,保留表觀遺傳信息。

Q4:單次實驗成本是否過高?

A:Evercode技術通過超高通量降低單細胞成本。例如,Evercode WT Penta試劑盒可分析500萬個細胞,性價比顯著優(yōu)于同類產品。

Q5:是否提供定制化服務?

A:是的!Parse提供從實驗設計到數(shù)據(jù)分析的全流程支持,包括基因組定制文庫構建和AI驅動的大規(guī)模篩選服務。


熱銷產品

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品名

規(guī)格

品牌

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