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利用血細胞計數板進行直接計數。
 計數前需對樣品做適當稀釋,然后將經過適當稀釋的菌懸液（或孢子懸液）放在血細胞計數板的計數室內,按照在顯微鏡下觀察到的微生物數目代入計算公式運算后,即可得出單位體積微生物總數目。
 此法的優點是直觀、快速。
 用于直接測數的菌懸液濃度一般不宜過低或過高（常大于106個/mL）。活躍運動的細菌應現用甲醛殺死或適度加熱以停止其運動。
 顯微計數法適用于各種含單細胞菌體的純培養懸浮液,如有雜菌或雜質,常不易分辨。
 菌體較大的酵母菌或霉菌孢子可采用血球計數板,一般細菌則采用彼得羅夫·霍澤（Petrof Hausser）細菌計數板。
 兩種計數板的原理和部件相同,只是細菌計數板較薄,可以使用油鏡觀察。而血球計數板較厚,不能使用油鏡,計數板下部的細菌不易看清。
 每個方格網共分九個大方格,中間的方格即為計數區。
 計數區分為16個中方格,而每個中方格又分成25個小方格，即計數區都由400個小方格組成。
 每毫升菌懸液中含有細胞數=每個小格中細胞平均數（N）³ 系數（Κ ）³ 菌液稀釋倍數（d）。