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HORIBA科學儀器事業部

HORIBA用戶報道|青島能源所實現毫秒級單細胞拉曼分選

時間:2017-12-6 閱讀:717
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作者 | 王喜先

 

單個細胞是地球上生命體功能和進化的基本單元,蘊藏著生長發育、衰老死亡、新陳代謝、信號傳導等眾多奧秘。單細胞精度的功能分選是解析每個細胞千差萬別的原因、探索自然界海量陌生細胞(不可培養微生物)的重要工具,分選通量的提高將幫助研究人員累積更多的研究樣本,拓展更廣的篩選范圍(自然環境、突變體庫等)。因此,實現單細胞精度的高通量功能分選至關重要。

 

 

zui近,中國科學院青島生物能源與過程研究所傳來喜訊,該所單細胞中心馬波研究員與徐健研究員帶領的多學科交叉團隊,將單細胞拉曼光譜(SCRS)與液滴微流控技術耦合,發明了高通量拉曼激活單細胞液滴分選技術RADSRaman-activated single-cell Droplet Sorting該工作于2017113日在線發表于美國化學會《Analytical Chemisrtry》。

注:單細胞拉曼光譜(SCRS)能夠在無標記、無損的前提下揭示細胞固有的化學組成。

 

 

巧妙的后液滴包裹設計

 

本研究開發的高通量拉曼激活單細胞液滴分選技術(RADS技術),是一種巧妙的“后液滴包裹”設計,它在微流控芯片的拉曼光譜檢測點后方引入液滴包裹單元,這樣就克服了制約通量提高的電磁閥作為分選驅動力的瓶頸問題,實現了基于介電力驅動的高通量分選。這使得從自然界中篩選新型的種子選手,或是從突變體庫中找到更的候選者,都變成現實。這項研究成功地將傳統的“先養再選”思路扭轉成了“先選再養”,避免了傳統分選的涂平板和挑克隆的過程,省去了擴大培養、提取以及定量等繁瑣過程。

與傳統技術相比,RADS技術的優勢為:

 

 

從篩選到采集,一體化拉曼分析過程
 

接下來我們就來看看整個從篩選到采集的工作是如何進行的。具體來說,如下圖,在微流控芯片中,細胞排著隊(從左向右)一個個經過拉曼檢測點(Raman),之后被逐個包裹在液滴(Oil)里面,與此同時計算機對采集到的單細胞拉曼信號進行判別,滿足分選條件的,啟動介電力(Dielectrophoresis),目標細胞將進入分選通道(Collect),而不滿足分選條件的細胞將流入廢液通道(Waste)。

拉曼激活單細胞液滴分選技術

 

在上述“流程”中的拉曼分析環節,研究團隊利用HORIBA HR 800型拉曼光譜儀來采集單細胞拉曼光譜信號,配置EMCCD使得信號強度大幅提升,這對分選通量提高起到了重要作用。

 

如果說微流控芯片、拉曼光譜儀及RADS是分析過程的三大核心結構,那么本項工作更加重要的總指揮則是團隊自主開發的分析軟件,該軟件將拉曼采集、分析、單細胞液滴包裹及分選過程集成在一起,充分實現了從分選到采集的高度自動一體化。

 

實踐中的應用

 

在上述分選技術的基礎上,研究團隊成功完成了大量實踐研究,如高產蝦青素之雨生血球藻的化(分選準確率98.3%)、高通量(260細胞/分鐘)篩選等,并通過實驗發現并證明,分選后92.7%的雨生血球藻細胞仍可保持活性并可增殖。相信后續還會有更多令人興奮的實踐研究成果不斷誕生。

 

本工作在中國科學院青島生物能源與過程所完成,同時得到了中科院武漢水生所胡強研究員、北京大學王瑋教授等的幫助,并得到了中科院儀器專項、國家自然科學基金、中國博士后科學基金和山東省自然科學基金等的支持。相關研究成果以“Raman-activated Droplet Sorting (RADS) for Label-free High-throughput Screeningof Microalgal Single-cells.”為題發表在《Analytical Chemisrtry》上。

   

后記

 

報道成文過程中,小編有幸采訪到以上研究的作者之一籍月彤老師,她告訴小編,“這是一個多學科交叉共同完成的工作,分析化學、生物化學、電子信息、自動化等背景的同事一起努力,zui終實現多信息獲取下的高通量分選方案。”

 

團隊介紹

 

 中科院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心(http://www.single-cell。。cn/)擁有約60人的研發隊伍,其核心使命是研制和應用示范包括單細胞拉曼成像、拉曼激活細胞分選、單細胞測序、單細胞培養等在內的新一代單細胞分析系列儀器,以及元基因組、拉曼組等生物大數據軟件,進而以微藻合成生物學、共生菌群與健康、海洋生物資源等為模式研究體系,探討單個活體細胞精度的微生物組功能與進化機制。
 

zui近,徐健研究員團隊還發明了基于拉曼組的單細胞快檢技術,能夠在單個細胞精度同時測定淀粉、甘油三酯、蛋白質含量以及油脂不飽和度,為細胞工廠的性能測試平臺增添了一個嶄新手段。該工作于1119日在線發表于Biotechnology for Biofuels

 

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結合旗下具有近 200 多年發展歷史的 Jobin Yvon 光學光譜技術,HORIBA Scientific 致力于為科研及工業用戶提供先進的檢測和分析工具及解決方案。如:光學光譜、分子光譜、元素分析、材料表征及表面分析等先進檢測技術。今天HORIBA 的高品質科學儀器已經成為科研、各行業研發及質量控制的。

 

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