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Paragon Genomics CleanPlex說明書
CleanPlex® Ready-to-Use NGS Panels | Product Sheet CleanPlex® BRCA1 & BRCA2 Panel v3
CleanPlex®即用NGS面板|產(chǎn)品表CleanPlex®BRCA1&BRCA2面板v3
Sensitive detection of somatic and germline mutations in BRCA1and BRCA2
BRCA1和BRCA2體細胞和生殖系突變的敏感檢測
亮點•目標區(qū)域的高覆蓋率以整個編碼區(qū)域為目標，包括在所有目標編碼外顯子周圍填充20個堿基•敏感檢測僅使用20 ng DNA檢測低至1%變異等位基因頻率的體細胞突變•快速，簡化的工作流程使用快速的三步協(xié)議在3小時內(nèi)生成可排序的庫•性能使用CleanPlex®技術準備高質(zhì)量的NGS庫，具有的目標一致性和覆蓋均勻性性能，以便有效地使用排序讀取并降低成本
CleanPlex®BRCA1和BRCA2面板v3是一種多重PCRBase靶向重排序分析，旨在簡化BRCA1和BRCA2基因體細胞和生殖系變異的評估。該小組的目標是BRCA1和BRCA2的所有外顯子區(qū)域和20bpof側翼內(nèi)含子序列。從20納克的DNA開始，測序準備好的文庫可以在3小時內(nèi)使用一個簡化的工作流程來準備。該面板經(jīng)過優(yōu)化，可提供高目標性能和高覆蓋均勻性的數(shù)據(jù)，以確保高效使用順序讀取。
靈敏的檢測CleanPlex BRCA1和BRCA2面板v3只需要20 ng輸入DNA（每個引物池10 ng），就可以檢測1%頻率的體細胞突變。平均擴增子大小為148bp，與從FFPE組織中分離的DNA等降解樣品也相容。
CleanPlex BRCA1和BRCA2面板v3規(guī)格
參數(shù)規(guī)范富集方法多重PCR測序平臺Illumina®離子流™ 基因數(shù)2靶點BRCA1和BRCA2基因的全外顯子累積靶點大小19785bp變異型SNV，索引若干擴增子237擴增子大小111-200bp（平均148bp）引物池數(shù)2輸入DNA要求10-40ng/池（推薦10 ng/池）血液、唾液樣本類型基因組DNA，或組織；FFPE DNA總分析時間3小時手控時間75分鐘設計覆蓋率100%覆蓋均勻性（平均覆蓋率>0.2X的靶點）≥95%靶點對齊讀數(shù)≥95%A。SNVs：單核苷酸變異；索引：插入缺失
CleanPlex流線型工作流CleanPlex BRCA1&BRCA 2 Panel v3提供了一個快速、流線型的工作流。從純化和定量DNA開始，基于多重PCR的方案可以在3小時內(nèi)完成，75分鐘的操作時間，使用三步工作流程，小的管到管傳輸。每個步驟包括一個熱循環(huán)或培養(yǎng)條件，然后使用磁珠進行“帶珠”純化.
CleanPlex背景清洗化學CleanPlex BRCA1和BRCA2面板v3由Paragon Genomics的CleanPlex技術提供動力，該技術使用專有的多重PCR背景清洗化學來有效去除非特異性PCR產(chǎn)品，從而獲得宜的目標富集性能和測序讀數(shù)的有效使用.
Recommended Sample Multiplexing for CleanPlex BRCA1 & BRCA2 Panel v3
每次運行的儀器樣品™ 100系統(tǒng)7 MiniSeq™ 系統(tǒng)（中輸出）14 MiniSeq系統(tǒng)（高輸出）45 MiSeq®系統(tǒng)（v2化學納米）1 MiSeq系統(tǒng)（v2化學微）7 MiSeq系統(tǒng)（v2化學）27 MiSeq系統(tǒng)（v3化學）45 A.每次運行的樣品預期平均讀取深度為5000x。
推薦
用于檢測種系突變：每次運行的儀器樣品™ 100系統(tǒng)73 MiSeq®系統(tǒng)（v2化學納米）18 MiSeq系統(tǒng)（v2化學微米）73 B。每次運行的樣品預期平均讀取深度為500倍。
產(chǎn)品SKU CleanPlex BRCA1&BRCA2 Panel v3（8個反應）916112
CleanPlex BRCA1&BRCA2 Panel v3（96個反應）916113
CleanPlex雙索引PCR引物，適用于Illumina集合A1（16個索引，16個反應）716005
CleanPlex雙索引PCR引物，適用于Illumina集合A（96個索引，96反應）716006
清潔磁珠（1毫升）718001清潔磁珠（5毫升）718002清潔磁珠（60毫升）718003
