免疫親和柱是液相色譜的心臟，在液相色譜儀的使用中，保持柱效、容量和滲透特性，延長柱子的使用壽命非常重要。主體上由柱體、柱內填料和兩端的接頭組成。由于使用了高效填料，并不需要很長的柱長。由于要承受系統高壓，所以柱體一般選用金屬材質。大部分接頭為通用尺寸，可互換使用。
顯然，尺寸大的高聚物分子，由于只能擴散到尺寸大的孔洞中，在免疫親和柱中保留的時間就短；而尺寸小的高聚物分子，幾乎能夠擴散到填料的所有的孔洞中，向孔內擴散的較深，在其中保留的時間就長。因此，不同分子量的高聚物分子就按分子量從大到小的次序隨著淋洗液的流出而得到分離。
那么如何對免疫親和柱進行有效的維護保養呢？
1、連接前確保系統已清洗干凈。在任何情況下不能碰撞、彎曲或強烈震動；很多單位的離子色譜儀是陰、陽離子混用的，因此，連接該產品前，一定要保證整個離子色譜儀上的所有閥件或管路已清洗干凈，避免造成堵塞。
2、確保不進入顆粒物。樣品一定要經過預處理，去除顆粒物等會給泵和本產品帶來負擔的物質。
3、確保不干燥。每天分析工作結束后，要清洗進樣閥中殘留的樣品，還要用適當的溶劑來清洗柱；若長期不使用，要參照保存辦法，在沖洗干凈后，對陰離子柱要通入一定濃度的堿（對陽離子柱要通入一定濃度的酸），并將其取下兩端密封保存。
4、確保在一定壓力、流速條件下運行。儀器使用時一定要先檢查整個流動管路中是否有氣泡，如果有，需要先將氣泡排除后再將其接上，防止將氣泡帶到本產品中。因為裝填的樹脂顆粒很小，氣泡進入后將影響樹脂和樣品中離子的交換，同時氣泡也將影響基線的穩定性。
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