1：在合適的鹽濃度下，應保持蛋白質(zhì)的大溶解性和可重復性。
2：選擇合適的表面活性劑和還原劑，破壞所有非共價結(jié)合的蛋白質(zhì)復合物和共價鍵二硫鍵，使其形成一個各自多肽的溶液。
3：盡量去除核酸，多糖，脂類等干擾分子。
4：防止蛋白質(zhì)在樣品處理過程中的人為的修飾，制備過程應在低溫下進行，以避免細胞破碎釋放出的各種酶類的修飾（建議加入合適的蛋白酶抑制劑）
5：樣品建議分裝成合適的量，然后冷凍干燥或直接以液體狀態(tài)置-80℃中保存，但要注意不要反復凍融。
下面我們詳細介紹一下western blot實驗的詳細步驟。
一：準備工作：
一個水浴箱，一臺超聲裝置，組織勻漿器
二：需要的溶液：
裂解液 Laemmli樣品緩沖液
三：操作步驟：
1)培養(yǎng)細胞蛋白質(zhì)樣品的制備：
1：胰酶酶解后裂解：
細胞培養(yǎng)80%左右密度時，以含0.05%胰蛋白酶消化，細胞經(jīng)預冷的PBS漂洗3次，離心收集在離心管中，加入450μl裂解液反復吹打。
2：皿上直接裂解：
細胞培養(yǎng)80%左右密度時，細胞經(jīng)預冷的PBS漂洗3次，加入450μl裂解液，細胞刮刀收集，用移液器轉(zhuǎn)移離心管中，反復吹打。
以上所得的樣品終用超聲細胞破碎儀超聲處理，超聲時為5S，間歇時間為10S，功率為100-120W溶液清澈無粘稠為止，處理過程在水浴中進行，后4℃25000g離心1小時取上清或以大強度超聲4次，每次15-30S，在每次超聲步驟之間將樣品轉(zhuǎn)置水浴中15S，加入Laemmli 樣品緩沖液（視蛋白樣品濃度，以1：1或1：2的比例混合），強力混勻，樣品置100℃水浴箱里水浴加熱3-5分鐘，10000g離心10分鐘，取出清液，將其移入另一潔凈試管中，此，電泳樣品已準備就緒。（樣品可立即使用也可以分裝凍存，-20℃存放的樣品可穩(wěn)定保持數(shù)月）。
2)組織樣品的制備：
手術(shù)切除的組織塊迅速置于預冷的0.95生理鹽水中，漂洗數(shù)次，以清潔表面的血跡，將組織稱量后切成幾個較小的組織塊放入機戒組織勻漿器中，按組織凈重，裂解液=1：10的比例，加入相應體積的裂解液進行勻漿，離心收集上清（如有粘稠物可超聲處理，具體方法見細胞培養(yǎng)的樣品制備，也可以冷凍干燥降解核酸后，將凍干的蛋白質(zhì)樣品溶解在適當?shù)纳蠘?buffer中，混勻后靜置3小時使樣品中的蛋白質(zhì)充分的溶解，有5分鐘即可，4度離心收集。）加入Laemmli樣品緩沖液（視蛋白樣品濃度，以1：1或1：2的比例混合）強力混勻，樣品置100度的水浴箱水浴加熱3-5分鐘，10000g離心10分鐘，取上清液，將其轉(zhuǎn)入另一潔凈的試管中，此，電泳樣品已準備就緒（樣品即可立即使用也可也可以分裝凍存，-20℃存放的樣品可穩(wěn)定保持數(shù)月。）
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