畜牧業是我國經濟發展的重要組成部分，對于基層養豬戶來說，由于受多種外在因素的影響，養豬場會出現多種豬類相關疾病。對于豬場養殖戶來說，豬仔患病，如果診斷治療不及時，有可能帶來巨大的經濟損失。常見豬類疫病如口蹄疫等多是由病毒引起，塞內卡谷病毒（SVV）也是其中一種。
山東師范大學生命科學學院碩士研究生導師陳蕾教授課題組在《Analytical Biochemistry》新發表了題為Recombinase polymerase amplification assay for rapid detection of Seneca Valley Virus 的研究論文，探討研究了重組酶聚合酶擴增 (RPA)快速檢測SVV的方法。
摘要內容
塞內卡谷病毒（SVV）的快速準確檢測對于確定致病因素和啟動控制措施的實施至關重要。 開發可在樣品采集點使用的快速、簡單、方便和低成本的分子（核酸擴增）測試方法已被確定為控制塞內卡谷病毒（SVV）的關鍵要素。作者研究團隊描述了針對 SVV 保守區域的重組酶聚合酶擴增 (RPA) 測試的開發，以用于檢測 SVV。 研究人員設計的引物和探針在RPA檢測中表現出良好的敏感性和特異性，有助于RPA成為快速診斷SVV的有效工具。
背景介紹
2002年，美國研究人員偶然從PER.C6細胞（轉化的胎兒成視網膜細胞）培養基中首（shou）次發現并分離到一種新的病毒——塞內卡谷病毒（Seneca Valley virus，SVV，又稱Seneca virus A，SVA）。塞內卡谷病毒（Seneca Valley Virus，SVV）屬于小RNA病毒科塞內卡谷病毒屬中的一員，臨床癥狀與其他水皰病臨床癥狀如口蹄疫類似，引起新生仔豬大量死亡和成年豬口部和蹄部出現水泡。
自2002年確定以來，SVV主要在美國和加拿大零星散發，但自2014年年底后，SVV先后在多個國家大范圍流行。2015年傳入中國以后，SVV先后在福建、廣州、湖南、湖北、安徽、江蘇、浙江、河南、河北、遼寧、黑龍江等12個省份引發疫病。塞內卡谷病毒（SVV）傳播特性與口蹄疫病毒類似，且與口蹄疫病毒存在混合感染，嚴重干擾了口蹄疫的防控。
目前多種分子技術手段已被用于檢測塞內卡谷病毒（SVV），包括聚合酶鏈式反應 (PCR)、滾環擴增 (RCA) 和環介導等溫擴增 (LAMP) 等。 在現有的等溫擴增技術中，重組酶聚合酶擴增 (RPA) 可能是最(zui)適用于現場和即時診斷（point-of-need diagnosis）的方法。
RPA利用低溫孵育（37–42℃）進行反應 ，只需最少的樣品制備，且擴增時間短（約20分鐘），靈敏度高（每個反應1-10 copies）。本研究介紹了SVV保守區引物和探針的設計，并評估了其在RPA實驗中的表現。
實驗方法：
試驗中用到的塞內卡谷病毒（SVV）cDNA、口蹄疫病毒 (FMDV) cDNA、豬呼吸與生殖綜合征病毒 (PRRSV) cDNA、豬瘟病毒 (CSFV) cDNA、豬流行性腹瀉病毒 (PEDV) cDNA、傳染性胃腸炎冠狀病毒 (TGEV) cDNA和陰性豬cDNA均由山東省疾病預防控制中心提供。本研究中使用的病毒樣本均在陰性豬cDNA 中稀釋到一定濃度。經基因工程技術把靶標基因克隆裝載到特定載體中，得到重組質粒 pET-32a SVV，重組質粒濃度為300 ng/μL。類似實驗操作的得到其它病毒質粒 (pET-32a-FDMV, pET-32a-PRRSV, pET- 32a-CSFV, pET-32a-PEDV, pET-32a-TGEV)。
之后設計并合成特定引物及探針，進行重組酶聚合酶擴增 (RPA) 測試，實驗反應在等溫擴增熒光檢測儀（H1600，柏恒科技）上進行，在 42°C 溫度條件下開始擴增，反應約20分鐘。產生高于陰性對照閾值的指數擴增曲線的樣品被認為是陽性的。后續研究團隊對RPA進行了特異性、敏感性及重復性的分析，結果均顯示良好。
結論：
該研究描述了RPA法檢測SVV的特異性引物和探針，具有良好的靈敏度和特異性，快至8分鐘即可產生陽性結果，一般不超過20分鐘。 塞內卡谷病毒（SVV）RPA檢測是在柏恒科技的等溫擴增熒光檢測儀H1600上進行的，儀器體積小，重量輕，方便攜帶。
實驗結果表明，特異性引物和探針有助于RPA技術成為SVV快速檢測的良好候選技術。它可以檢測患病動物，以便及時治療和控制感染傳播。
實驗中用到的等溫擴增熒光檢測儀H1600為柏恒科技生產，儀器檢測快速，體積小，可用于便攜式操作，適用牧場、林場、動物疫病檢測等多場景。
此外柏恒還提供動物疫病檢測解決方案，我們提供包括離心機、金屬浴、PCR儀等全流程實驗儀器，更多內容，歡迎咨詢聯系。
參考文獻：
[1] A.J. Bracht, E. O’Hearn, A.W. Fabian, R.W. Barrette, S. Abu, K. Bernhard, Real-time reverse transcription PCR assay for detection of senecavirus A in swine vesicular diagnostic specimens, PLoS One 11 (1) (2016), e0146211.
[2] M.E. A, Y.W. B, O.N. C, O.P. C, F.T.H. A, M.W. A, Recombinase polymerase amplification assay for rapid detection of Rift Valley fever virus, J. Clin. Virol. 54 (4) (2012) 308–312.
[3] M. Euler, Y. Wang, P. Otto, H. Tomaso, M. Weidmann, Recombinase polymerase amplification assay for rapid detection of francisella tularensis, J. Clin. Microbiol. 50 (7) (2012) 2234–2238.
[4] J. Wang, Y. Zhang, R. Zhang, Q. Han, J. Wang, L. Liu, R. Li, W. Yuan, Recombinase Polymerase Amplification Assay for Rapid Detection of Porcine Circovirus 3, Molecular & Cellular Probes, 2017, S0890850817300890.
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