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辣椒（Capsicum annuum）是一種重要的經濟作物，它在滿足人們口腹之欲的同時，還是世界上廣為使用的藥物。辣椒富含維生素和營養，可以用來生產許多藥物、天然染色劑和化妝品。
為了更好的理解辣椒屬的進化、馴化和特化，四川農業大學玉米研究所、遵義農科院辣椒研究所、華南農業大學園藝學院、華大基因等機構的研究人員對栽培辣椒及其野生祖先進行了基因組測序。文章于三月三日發表在美國國家科學院院刊PNAS雜志上。
研究人員獲得了3.48Gb的基因組草圖，并對其中79%的基因進行了染色體定位，獲得了高密度的遺傳圖譜。研究顯示，反轉錄轉座元件的快速擴增，使辣椒基因組與其它茄科植物的基因組相比發生了擴張。在辣椒基因組中，約81%都是重復性序列。
研究人員比較了栽培辣椒Zunla-1 (C. annuum L.)及其野生祖先 Chiltepin (C. annuum var. glabriusculum)的基因組，發現了人工選擇的分子足跡，找到了一系列候選馴化基因。研究指出，串聯重復基因的劑量補償效應可能為辣椒賦予了辣味上的多樣性。
這項研究不僅為辣椒基因組和茄科基因組的進化研究提供了關鍵信息，還有助于人們開展更有效的辣椒育種項目。(此前，另一個研究團隊也發布了辣椒的基因組測序成果，詳見：Science新聞，辣椒基因組測序完成)