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技術文章

Taqman-LNA探針的合成

點擊次數:6493 發布時間:2009-3-16

什么是LNA
    LNA 是新型的核酸類似物,它包含了2'-氧4' 碳亞甲基連接,這個連接限制了呋喃核糖環的靈活性,因而將其結構鎖定成一個剛性的雙環模式,因此而提高雜交效率和*的穩定性。

LNA 熒光探針優點:

1.增強熱穩定性和雜交的特異性
   對實時定量PCR探針提出LNA化學產品增強雙鏈體的熱穩定性,同時加強對目標序列雜交的特異性。因此,由非所需激活的熒光背景將大量減少,從而使信號對背景噪音的比例增大。

   LNA 單分子的化學結構決定了其探針與目標序列雜交后的穩定性,與普通的DNA熒光探針相比,其雙鏈在相同的鹽溶液中,每增加一個單體LNA分子將導致其熔點提升8°C。強化后的雜交性能可以顯著的擴大實驗檢測的環境限制,同時允許在單試管中進行更復雜的試驗。可以通過調整LNA堿基在探針中的位置來調節*熔點(Tm)和雜交的特異性。

2.更易及靈活的探針設計來檢測有問題的目標序列

   由于LNA 強化的雜交特征和對熔點溫度的影響,含有LNA的實時定量PCR探針,長度較短,可以增加設計的靈活性,同時附和檢測設計的指南。因此普通DNA探針某些設計的局限或無法解決的問題都可被減少或消除。
例如, 含大量AT的實時定量PCR探針通常需要30堿基以上(有時超過40堿基)來達到擴增設計的指南,但是可能效果較差。LNA熒光探針的應用可靈活選擇LNA的位置,以達到高特異性的設計,短的探針可以很有效的工作,甚至短到13到20個堿基。

3.適用于多種實時定量PCR 系統
   LNA 熒光探針適用于多種實時定量PCR 系統,這基于染料和設備的激發/發射的波長。這為您提供在固定的周期實驗環境下自由的選擇儀器與試劑系統的組合。這無需額外的資本投入。

 

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