    色譜儀在運(yùn)行前，需要更換色譜柱、流動(dòng)相，啟動(dòng)泵和檢測器，并對(duì)衰減、流速、紙速等進(jìn)行設(shè)置，所以操作比較復(fù)雜。另外，色譜儀的型號(hào)比較多，各種型號(hào)色譜儀的操作界面都不盡相同，尤其是計(jì)算機(jī)工作站的引入，使得各種型號(hào)色譜儀的操作差別更大。
2）標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)是主要的計(jì)量裝置
    不論是氣相色譜儀，還是液相色譜儀，基線噪聲、基線漂移、更小檢測濃度都是三個(gè)更重要的指標(biāo)，而對(duì)它們的檢定只需使用標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)即可進(jìn)行
3）維修困難
     色譜儀的內(nèi)部電路非常復(fù)雜，而且零部件的更換必須使用相應(yīng)廠家生產(chǎn)的配套產(chǎn)品，因而維修比較困難。
4）檢定時(shí)間長
      檢定一臺(tái)色譜儀一般需要3-5個(gè)小時(shí)，時(shí)間較長。色譜儀在運(yùn)行前首先要進(jìn)行1-2小時(shí)的預(yù)熱，否則儀器的基線難以穩(wěn)定。另外在在檢定過程中，基線和重復(fù)性的檢定也都需要較長的時(shí)間。

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