按結構可分為氣源、進樣系統、分離系統、溫控系統、檢測系統和數據處理系統 6 部分。任何部分出現故障，都會影響整個儀器的正常運行，從而影響分析工作的正常開展。
 
 
對進樣系統進行維護
 
根據進樣器針頭尺寸、進樣口溫度、壓力等因素，進樣 50 ～100 次后應更換進樣墊; 對進樣口的玻璃襯管進行定期清洗; 玻璃襯管使用時應放置適量的石英棉; 微量注射器使用前后應用丙酮或其他合適的溶劑進行清洗，以防污染堵塞。定期清洗進樣口玻璃襯管的方法: 先用丙酮等有機溶劑清洗，晾干后，置于配制好的 5%DMCS － 正己烷溶液中浸泡，12h 之后拿出并立即用甲醇清洗 2 ～3次，再在甲醇中浸泡約 1h，取出晾干，與干燥劑一起密封放置。

對色譜柱進行維護
 
新買的色譜柱在使用前需老化處理并檢測其性能; 安裝毛細管色譜柱時，需保持兩端切口平整，安裝長度根據儀器要求可借助氣相色譜儀附帶工具測量; 色譜柱若留置在加熱柱箱中，必須保證有載氣通過; 色譜柱從色譜儀卸下后，填充柱兩端需用不銹鋼螺帽套上，毛細管柱兩端可在進樣墊上扎一個小孔套上，保存于原柱包裝盒中。重新安裝時，毛細管柱需把兩端切掉 2 ～4cm，以保證不會被進樣墊碎片堵塞。
 

對檢測器進行維護
 
檢測器的維護主要是清洗，但需根據指導書或在專業人員的指導下進行。現對使用廣泛的氫火焰離子化檢測器進行討論:
a． 為避免外界干擾，離子室的環境應該保證屏蔽、干燥和清潔。
b． 檢測器使用溫度設定應不低于 150℃，建議 200℃以上，待溫度穩定一段時間后再點火，以除去檢測器存留的水分。關閉前先關閉氫氣，保留空氣 10 ～20min，可避免部分雜質附著。
c． 根據樣品具體情況適時對檢測器噴嘴、收集極進行清洗。清洗時需防避尖銳物件劃傷噴嘴和收集極，造成新活化點出現。安裝時需戴手套，不可用手直接接觸零部件。

對氣源進行維護
 
購買純度符合標準要求的氣體，條件允許可購買純度 99． 999% 以上; 使用氫氣和空氣發生器，定期進行排水并更換干燥劑和分子篩; 當鋼瓶壓力不足 2.0MPa 時，需及時更換，更換后應對管路連接口進行檢漏。