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基因修復實驗

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基因修復

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一、基因修復的核心概念與生物學意義

基因修復(DNA Repair)是細胞識別并糾正DNA損傷(如突變、斷裂、化學修飾)的分子機制,對維持基因組穩定性至關重要。若無xiu復機制,自發突變率將提高1000倍以上。其核心價值包括:

  1. 防御遺傳錯誤:防止點突變、插入/缺失等變異累積。

  2. 保障細胞功能:避免因DNA損傷導致細胞凋亡或癌變。

  3. 進化平衡:在修復保真度與允許適度變異之間取得平衡,支持適應性進化。


二、主要修復機制的分類與分子途徑

根據損傷類型與修復策略,可分為以下五類:

(一)錯配修復(Mismatch Repair, MMR)

  • 作用目標:復制錯誤導致的堿基錯配(如A-C配對)、單堿基插入/缺失。

  • 關鍵步驟

    1. 識別:MutS蛋白(原核為MutS,真核為MSH2/MSH6)識別錯配位點。

    2. 鏈區分:通過新合成鏈的未甲基化狀態(原核)或PCNA標記(真核)確定需修復鏈。

    3. 切除與修復:MutL/ExoI切除錯誤片段,DNA聚合酶δ/ε和連接酶完成修復。

  • 疾病關聯:MMR缺陷導致遺傳性非息肉性結直腸癌(HNPCC)。

(二)切除修復(Excision Repair)

根據損傷范圍細分為三類:

  1. 堿基切除修復(Base Excision Repair, BER)

    • 目標:氧化/烷基化損傷的堿基(如8-氧niao嘌呤)。

       
    • 流程

  • DNA糖基化酶切除受損堿基 → AP位點形成 → AP內切酶切割磷酸二酯鍵 → DNA聚合酶β填補 → 連接酶封閉缺口。

  1. 核苷酸切除修復(Nucleotide Excision Repair, NER)

    • 目標:紫外線誘導的嘧啶二聚體、化學加合物等大片段損傷。

    • 機制

  • XPC-RAD23B復合物識別損傷 → TFIIH解旋DNA → XPA/XPG切除含損傷的24-32 nt片段 → DNA聚合酶δ/ε/κ合成新鏈。

    • 疾病關聯:NER缺陷導致著色性干皮病(Xeroderma Pigmentosum)。

  1. 直接修復(Direct Repair)

    • 目標:特定化學修飾(如O?-甲基niao嘌呤)。

    • 酶介導:MGMT蛋白直接轉移甲基基團,無需切除。

(三)雙鏈斷裂修復(Double-Strand Break Repair, DSBR)

DNA雙鏈斷裂是最致命損傷,主要通過兩條通路修復:

  1. 非同源末端連接(Non-Homologous End Joining, NHEJ)

    • 特點:快速但易出錯,直接連接斷裂末端。

    • 關鍵蛋白:Ku70/80識別斷裂 → DNA-PKcs激活 → XLF/XRCC4/Ligase IV連接。

    • 風險:易導致插入/缺失突變(indel),是CRISPR編輯中脫靶效應的主因。

  2. 同源重組修復(Homologous Recombination, HR)

    • 特點:高保真,需姐妹染色單體作為模板。

    • 流程

  • MRN復合物切除5'端 → RAD51形成單鏈DNA-蛋白絲 → 侵入同源模板 → DNA合成 → Holliday連接體解離。

    • 應用:CRISPR-HDR技術實現精確基因敲入或點突變修復。

(四)合成依賴性鏈退火(Synthesis-Dependent Strand Annealing, SDSA)

  • 定位:HR修復的亞型,避免交叉重組。

  • 機制

    • 斷裂端切除后侵入同源模板 → DNA合成延伸 → 新生鏈脫離模板與另一斷端退火 → 連接完成修復。

  • 技術價值:CRISPR結合單鏈寡核苷酸(ssODN)的ExACT模型即基于SDSA,實現點突變的精確修復。




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