如何選擇合適的蛋白質定量技術：iTRAQ vs SILAC檢測技術服務詳情介紹

在dànbáizhì組學研究中，準確的dànbáizhì定量技術是揭示生物過程變化的核心。iTRAQ和SILAC作為兩種廣泛應用的dànbáizhì定量方法，各自具備dútè優勢與局限。理解兩者的技術原理、適用場景與關鍵差異，對于制定高效可靠的實驗方案至關重要。

一、iTRAQ與SILAC的基本原理解析

1、iTRAQ技術簡介

iTRAQ（Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation）是基于同位素標記的定量策略，通過在dànbáizhì酶解后的肽段上進行化學標記，使不同樣本中的同一肽段在質譜中產生不同質量的報告離子。通過測量報告離子強度，可以推算出各樣本中dànbáizhì的相對豐度。iTRAQ支持4-plex、8-plex甚至16-plex標記，適合多樣本同時分析。

2、SILAC技術簡介

SILAC（Stable Isotope Labeling by Amino acids in Cell culture）則是一種代謝性標記技術，通過向細胞培養基中添加含穩定同位素的必需氨基酸，使細胞在生長過程中將標記氨基酸自然整合到dànbáizhì中。輕重肽段在質譜檢測時表現出可區分的質量差異，實現樣本間的相對定量。SILAC標記效率高、實驗流程簡潔，特別適用于動態變化分析。

二、iTRAQ與SILAC的應用特性比較

1、樣本類型適用性

• iTRAQ適用于各種類型的dànbáizhì樣本，包括細胞、組織、血漿、血清及臨床樣本。由于標記在肽段水平進行，不依賴于細胞培養，可靈活應用于各種生物材料。

• SILAC則主要用于可以體外培養的細胞系，例如HeLa、293T等人源細胞。對于不可培養或難以標記的樣本，如組織切片或血液樣本，SILAC不適用。

2、定量精度與信號一致性

• iTRAQ在復雜樣本中可能出現比值壓縮（Ratio Compression）現象，即低豐度信號被背景噪聲稀釋，導致實際差異低估。但借助高分辨質譜儀器與優化分離技術，可以有效減輕這一影響。

• SILAC因標記在細胞生長階段完成，避免了酶解或后處理過程中的人為偏差，定量結果高度準確，適合追蹤微小的表達變化。

3、實驗通量與數據規模

• iTRAQ支持高通量分析，一次性處理4-16個樣本，大幅提高了數據生成速度，適合多組別、多變量的大規模項目，如藥物篩選、時間序列分析。

• SILAC通常處理2-3個條件組（輕、中、重標簽），適合處理簡單的實驗設計，例如藥物處理前后或敲除/過表達實驗，但在處理復雜實驗時存在一定限制。

三、選擇dànbáizhì定量技術的關鍵考量因素

1、研究目標與實驗設計

• 若需要比較多個實驗組，如多劑量梯度、多時間點采樣或多臨床樣本分析，iTRAQ憑借高通量能力更能勝任。

• 若研究關注動態生物過程，如細胞信號通路響應、dànbáizhì翻譯后修飾變化等，且樣本為可培養細胞，SILAC以其高準確性和低變異性更具優勢。

2、樣本來源與制備條件

• 當實驗材料為血清、血漿、組織或固定樣本，可以選擇iTRAQ。iTRAQ不依賴細胞代謝活性，因此能覆蓋更廣泛的樣本類型。

• 對于體外培養且能耐受同位素標記培養基的細胞系，SILAC可以實現近乎無偏差的內源標記，適合高精度需求的基礎研究。

3、數據分析需求與技術挑戰

• iTRAQ實驗數據較大，且由于比值壓縮效應，數據分析需要使用高效、專門的軟件工具（如Proteome Discoverer），并結合正交驗證方法增加可信度。

• SILAC數據相對簡潔，輕重肽段對應，便于初步分析和定量，但當涉及多重修飾或多狀態比較時，數據處理也需zhuānyè軟件支持，如MaxQuant。

iTRAQ與SILAC作為dànbáizhì定量的兩大主流技術，各自在不同研究需求中展現出dútè優勢。合理評估實驗樣本、研究目標、預算及實驗條件，科學選擇適合的定量方法，將直接決定項目的效率與數據質量。在追求jīngzhǔn科學探索的道路上，百泰派克生物科技致力于為科研人員提供zhuānyè、高效、可信賴的定量蛋白組分析服務，與您攜手推進生命科學的邊界。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術優良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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