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4D-DIA如何提升復雜樣本中的蛋白識別率?檢測技術服務詳情介紹
在蛋白組學研究中,樣本復雜性是影響數據質量的關鍵因素。無論是組織樣本、體液樣本,還是固定保存的臨床材料,其共同特點都是蛋白種類繁多、豐度跨度大、干擾物多,給dànbáizhì識別和定量帶來巨大挑戰。數據非依賴采集(DIA)技術雖然具備高重現性和高通量,但在面對復雜背景時仍存在蛋白識別率偏低、低豐度蛋白難以覆蓋等問題。近年來,4D-DIA(四維數據非依賴采集)技術的興起,為解決這一問題提供了全新思路。該技術通過引入“離子淌度”作為第四維度,有效提升了復雜背景下的譜圖分辨率和肽段識別率。
一、4D-DIA:加入“離子淌度”的四維質譜分析
DIA是一種面向全掃描的質譜采集策略,避免了依賴DDA(數據依賴采集)中隨機挑選母離子的局限性。然而,在復雜樣本中,多個肽段可能在同一窗口內共洗脫,產生譜圖重疊,影響肽段的jīngquè識別。4D-DIA在三維基礎上(保留時間、質荷比、離子強度),引入離子淌度(Ion Mobility)這一物理分離維度。其核心是利用電場對帶電肽段在高壓氣流中進行分離,不同結構和形狀的肽段具有不同的淌度值,從而實現比色譜更細致的肽段區分。這種技術通常依托如Bruker timsTOF等設備完成,能夠在不顯著犧牲速度的前提下,獲得更純凈、更高質量的譜圖。
二、4D-DIA如何提升蛋白識別率?
1、減少共洗脫干擾,提高譜圖純凈度
離子淌度分離使得在質荷比和保留時間重合的情況下,不同肽段仍能被準確區分,從而減少譜圖重疊和干擾,提高匹配效率。
2、提升低豐度蛋白識別能力
在常規DIA中,低豐度肽段往往被高豐度離子的信號覆蓋。4D-DIA通過分離更多維度的特征,使得原本被掩蓋的信號得以顯現,增強低豐度蛋白的檢測能力。
3、增強定量線性范圍和重復性
4D-DIA提升了信號解卷積精度,使得在復雜背景中仍可實現良好的定量一致性,尤其適用于生物學重復樣本的大規模篩查。
4、適配優良AI識別算法
如DIA-NN等軟件已原生支持4D數據格式,結合深度學習模型進一步提升譜圖解讀效率,使4D-DIA成為復雜樣本組學研究的強力引擎。
三、4D-DIA應用于哪些復雜樣本類型更具優勢?
4D-DIA對大多數蛋白組樣本都有良好的適配性,尤其在以下幾類中優勢更加突出:
血清/血漿等體液樣本:動態范圍大,4D-DIA可提升低豐度信號檢測。
石蠟包埋組織(FFPE)樣本:蛋白交聯和降解嚴重,需更高分辨率譜圖解析。
外泌體/細胞間小體樣本:目標蛋白豐度低,背景復雜。
異質性組織(如腫瘤):細胞亞群差異顯著,4D分離可提高分型準確度。
4D-DIA通過引入離子淌度維度,顯著提高了復雜背景下的蛋白識別效率、定量準確性和低豐度蛋白覆蓋能力,成為當前蛋白組學研究的熱點方向。特別是在面對高異質性、高動態范圍和高背景干擾的樣本時,其表現尤為出色。隨著軟硬件生態的不斷成熟,4D-DIA將在疾病標志物篩選、jīngzhǔn醫療、免疫研究、空間蛋白組等方向發揮日益重要的作用。百泰派克生物科技致力于提供高質量的DIA定量dànbáizhì組學服務,無論是基礎研究、藥物機制解析,還是臨床樣本隊列研究,我們都能為您提供zhídexìnlài的技術支持。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!