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化工儀器網>產品展廳>試劑標物>行業專用試劑>生化與分子生物學用試劑> DNA 探針生物-素標記試劑盒(PCR 法)

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DNA 探針生物-素標記試劑盒(PCR 法)

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上海烜雅生物科技有限公司是一家專注于生物技術研發、生產和銷售的企業,致力于提供高品質的科研試劑和技術服務,滿足多領域生物科技實驗需求。公司產品涵蓋酶聯免疫檢測試劑盒、分子生物學檢測試劑盒等上萬種科研試劑,以過硬的質量和優良的服務贏得市場認可。

 

科研試劑,檢測試劑盒,原代細胞,細胞系,菌種,核酸染料,熒光PCR試劑盒,ELISA檢測試劑盒,染料法PCR試劑盒,質粒基因

供貨周期 現貨 規格 5次
貨號 XY-D-1663 應用領域 化工,生物產業
主要用途 科研 英文名稱 DNA Probe Biotin-labeling Kit
保存條件 -20℃ 有效期 12個月
  產品簡介:
 
  
 
  用 PCR 對 DNA 進行生物-素標記的原理是用帶生物-素標記的 dNTP 進行PCR 擴增,這些 dNTP 摻入到PCR 產物中之后,擴增得到的 DNA 片段自然就帶有生物-素標記,可以直接用于雜交試驗。本產品就是基于上述原理開發的。
 
  產品特點:
 
  1.一站式,本試劑盒經過精心優化,不需要用戶自己摸索標記條件。
 
  2.優化的生物-素摻入率,能有效降低探針中生物-素分子之間的可能空間阻礙,檢測效果佳。
 
  3.得到的生物-素標記DNA 探針可以用于 Southern 雜交、Northern 雜交、原位雜交、菌落雜交和斑點印跡雜交等分析。
 
  4.既可用于制備雙鏈DNA 探針,也可以用于制備單鏈 DNA 探針。
 
  5.一次標記反應可以得到μg 級的生物-素標記雙鏈 DNA 探針或約 700 ng
 
  生物-素標記單鏈DNA 探針,足夠多次雜交實驗用。
 
  6.本產品足夠 5 次生物-素標記 PCR 反應(50 μL 體系)。
 
  7.DNA 探針生物-素標記試劑盒(PCR 法)只能用于科研。
 
  產品參數:
 
  產品規格
 
  成份規格包裝
 
  標記專用PCR Mix(含酶)30 μL0.5 mL 紅蓋管
 
  dNTP Mix,2.5 mM each25 μL0.5 mL 白蓋管
 
  含 Biotin-11-dUTP 的
 
  dNTP,2.5 mM each25 μL0.5 mL 綠蓋管
 
  超純水1 mL1.5 mL 藍蓋管
 
  使用手冊1 份無
 
  保存和運輸
 
  低溫運輸,-20℃保存,有效期一年。
 
  自備試劑
 
  無
 
  使用方法:
 
  DNA 模板和模板專一性引物,常規 PCR 反應所需試劑,瓊脂糖凝膠 DNA回收試劑盒。
 
  一:準備工作
 
  1.按常規的方法設計PCR 引物,使 PCR 產物(探針)長度在 400-800 bp
 
  之間。過短則生物-素標記摻入少,探針雜交信號強度減弱;過長則非特異雜交增加,背景變強。
 
  2.為保證成功率,最好先用常規 PCR 產物制備 DNA 片段,再以之為模板進行標記PCR 反應。不推薦以基因組 DNA 或其他背景復雜的 DNA 為模板直接進行 PCR 標記反應。
 
  二:用常規PCR 制備模板
 
  3.用自備的 PCR 試劑盒按下表配置 50 μL 的常規 PCR 反應以制備標記
 
  PCR 模板:
 
  成份加入量
 
  自備的 2×PCR Mix(含酶,含 dNTP)25 μL引物一和引物二(10 pmol/μL)各 5 μL
 
  1 μg 基因組 DNA 或 1 ng 質粒 DNA1 μL
 
  超純水補到 50 μL
 
  4.按引物 Tm 值設計的PCR 參數進行常規PCR。
 
  5.用自備膠回收試劑盒回收常規PCR 產物并定量。膠回收步驟可以去殘留引物,避免這些引物干擾后續的標記 PCR 反應。
 
  三:標記 PCR 反應
 
  注意:由于雙鏈PCR 探針在雜交時變性的雙鏈彼此還會復性,降低雜交效率,因此強烈推薦使用單鏈標記 PCR。在設置標記 PCR 時必須做一個
 
  常規PCR 對照(本試劑盒足夠 5 次標記 PCR 實驗)。
 
  成份標記PCR常規PCR(自備)
 
  標記專用PCR Mix(含酶)6 μL6 μL
 
  含 Biotin-11-dUTP 的
 
  dNTP,2.5 mM each5 μL不加
 
  dNTP Mix,2.5 mM each不加5 μL
 
  若雙鏈標記,加引物一和引物二;
 
  若單鏈標記,只加一條引物
 
  各 50 pmol
 
  各 50 pmol
 
  膠回收所得 PCR 產物10 ng(對雙鏈標記)
 
  100 ng(對單鏈標記)10 ng(對雙鏈標記)
 
  100 ng(對單鏈標記)
 
  超純水補到 50 μL補到 50 μL
 
  6.由于此步所用的 PCR 引物和第 3 步的 PCR 引物完-全一樣,故可以參考第 3 步PCR 參數進行標記 PCR,但需要進行下列修改:一是循環數增加到 35-55 個循環,使擴增得到的探針 DNA 片段參差不齊,雜交時這種DNA 能形成網絡結構,雜交效果比長度整齊的 DNA 更好;二是延伸步驟的時間增加 15 秒,因為標記 dUTP 摻入到DNA 的速度比常規的 dTTP 慢,增加延伸步驟的時間可以保證更多的標記 dUTP 摻入到合成的DNA 探針中;三是降低復性溫度 5-7℃,因為標記核苷酸摻入到 DNA 后,含標記核苷酸的 DNA 的 Tm 值將比正常的DNA 低。
 
  7.PCR 結束后,取標記 PCR 反應液和對照反應液 3-5 μL 進行瓊脂糖凝膠
 
  電泳(一定要使用濃度已知的 DNA marker),檢測標記是否成功。由
 
  于標記 DNA 含有額外的標記物、分子量更大,其泳動速度將慢于常規PCR 產物。下圖是一個典型的雙鏈標記 PCR 產物和常規 PCR 產物電泳速度差異的比較圖:
 
  標記的 DNA(右)與未標記的 DNA(左)電泳比較
 
  8.探針的定量:電泳所用的DNA marker 濃度已知(如果不確定,可以問供應商),上樣體積已知,故上樣量已知,就可通過雙鏈探針 DNA 和DNA marker 對應條帶的相對亮度來估計探針 DNA 濃度。例如,如果探針長度為 500 bp,而 marker 中 500 bp 這條帶的濃度是 10 ng/μL,共上樣 10 μL,則 500 bp 這條帶的上樣量為 100 ng。標記的探針 DNA在紫外下亮度只有它的一半,則探針 DNA 的上樣量為 100/2=50 ng, 如果上樣量是 5 μL,則探針的濃度是 50/5=10 ng/μL。但是,如果制備的是單鏈 DNA 探針,則不能按此法估計濃度,因為單鏈 DNA 結合核酸染料(如 EB 和 SYBR GreenI)的能力遠低于雙鏈 DNA。但可采用銀染法定量(跟marker 比較)。一般 100 ng 模板經單鏈標記 PCR 擴增可得到 700 ng 左右的單鏈探針。
 
  9.單鏈 PCR 標記產物可不經純化直接加到雜交液中,雙鏈 PCR 標記產物需加熱到 95-100℃ 5 分鐘變性然后放冰上急冷后再加到雜交液中使用。
 
  10.如果探針不立即使用,需要放-20℃長期保存,不能放常溫保存,否則 Taq DNA 酶的殘留的外切酶活性會降解探針 DNA。如果需要純化探針 DNA,請使用本公司的核酸探針純化試劑盒(排阻層析法)。
 
  選擇我們的DNA 探針生物-素標記試劑盒(PCR 法),就是選擇精準、高效、可靠的檢測方案,為您的科研實驗保駕護航!


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