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一般顯微鏡分為鹵素光源和LED光源，他們各有優缺點。在安裝顯微鏡燈泡之前我們先要了解各個光源的特點，以便于安裝。鹵素燈優點是光譜比較長，接近于太陽光，對于觀察而言，更加真實；缺點在于壽命較短且在觀察某些物質時，失真也是有可能的，這個時候就需要使用到濾色片，一般來說，能夠滿足觀察要求。相對于鹵素光源，LED的優點是價格較鹵素燈便宜，使用壽命相對較高，亮度非常高，在視野中能夠看得比較清晰。缺點是由于是單波長的光，所以一般只能針對某些物質，在很多情況下會失真。
另外需要注意的是不同的照明方式，燈泡在顯微鏡的不同部位。一般臨界照明式（照明源與物鏡光軸重合）顯微鏡的光源燈大都在顯微鏡的底座下有一個小手柄，拉動手柄可打開光源燈室的槽蓋；另一種柯拉照明式（照明光源與物鏡光軸成垂直）顯微鏡的光源燈在鏡臂后部，也同樣有一光源燈室或燈室罩。
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